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近江牡蛎SLC13基因家族的全基因组鉴定及急性高盐胁迫下的表达特征

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溶质载体13(solute carrier 13,SLC13)是SLC转运蛋白超家族的重要成员,编码结构相似的跨膜蛋白,在介导转运阴离子和柠檬酸循环代谢中间体中发挥重要作用.近江牡蛎(Crassostrea ariakensis)基因家族收缩和扩张分析表明,SLC13家族显著扩张,可能与渗透压调节密切相关.为进一步探讨近江牡蛎SLC13基因家族(CarSLC13)特征及在高盐胁迫下的表达变化,本研究运用生物信息学方法对CarSLC13进行鉴定,并分析了其基因结构、染色体定位、系统进化和在急性高盐胁迫后鳃组织中的表达特征.本研究共鉴定出11个CarSLC13基因,包括1个CarSLC13A1亚家族成员,6个CarSLC13A2亚家族成员和4个CarSLC13A5亚家族成员,其中7个家族成员蛋白的理化性质较为稳定,不稳定系数均小于40;亚细胞定位预测显示,所有CarSLC13均定位到细胞膜或内膜;染色体定位结果显示,11个SLC13基因定位在6条染色体上,在第3号染色体上的部分基因发生了串联复制;该基因家族成员都具有钠-硫酸盐共转运蛋白跨膜结构域(PF00939),该结构域与渗透压调节功能相关;盐度为40的人工海水急性胁迫近江牡蛎0h、6 h和12 h后,鳃组织中的CarSLC13A2和CarSLC13A5亚家族的基因整体上表现为先升高再降低的表达趋势,而CarSLC13A1亚家族基因表达量随胁迫时间的增加而降低.本研究明确了 CarSLC13家族的基因特征、系统进化及对急性高盐胁迫的响应规律,丰富了双壳贝类SLC13基因家族的研究资料,为进一步探讨该家族在渗透压调节中的作用提供了参考数据.
Genome-wide identification of the SLC13 gene family in Crassostrea arakensis and its expression characteristics in gill under acute salt stress

葛广玉、迟长凤、王振原、刘志鸿、王岩、陈夕、孙秀俊、周丽青、吴彪

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浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江舟山316022

农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071

青岛海洋科学与技术试点国家实验室,海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,山东青岛266273

近江牡蛎 SLC13基因家族 高盐胁迫 表达模式

青岛海洋科学与技术试点国家实验室山东省专项经费项目山东省重点研发计划中央级公益性科研院所基本科研业务费项目国家重点研发计划

2021QNLM0501032021LZGC0282021XT01012022YFD2400100

2023

10.12264/JFSC2022-0328

中国水产科学
中国水产科学研究院 中国水产学会

中国水产科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.206
ISSN：1005-8737
年,卷(期)：2023.30(2)
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