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从表型到分子:革命性的肠道菌群鉴定方法

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肠道菌群是由许多细菌及其代谢产物组成的复杂生态系统，对人体消化、营养吸收、能量供应、脂肪代谢、免疫调节等诸多方面发挥着不可替代的作用。探索肠道菌群的结构与功能、关键基因与代谢产物，将有助于实现疾病的早期诊断与辅助诊断，发现新的治疗靶点与药物治疗效果评价，更好地指导抗生素的使用。肠道菌群的鉴定在临床诊疗及药物研发等领域都具有重要作用，因此，有必要对这一迅速发展的领域进行全面回顾。传统的鉴定方法无法全面捕捉肠道微生物多样性。随着分子生物学的快速发展，肠道菌群的分类鉴定也从最初的表型鉴定和化学鉴定演变到了分子水平鉴定。本综述整合了肠道菌群的主要鉴定方法及其应用评价，特别关注于分子生物学方法的研究进展，并重点介绍了高通量测序技术在肠道菌群鉴定中的应用，这种革命性的肠道菌群鉴定方法预示着人类对微生物世界认识的全新篇章。
From Phenotypes to Molecules:Revolutionizing Gut Microbiota Identification Methods
The gut microbiota is a complex ecosystem composed of many bacteria and their metabolites.It plays an irreplaceable role in human digestion,nutrient absorption,energy supply,fat metabolism,im-mune regulation,and many other aspects.Exploring the structure and function of the gut microbiota,as well as their key genes and metabolites,will enable the early diagnosis and auxiliary diagnosis of disea-ses,new treatment methods,better effects of drug treatments,and better guidance in the use of antibiot-ics.The identification of gut microbiota plays an important role in clinical diagnosis and treatment,as well as in drug research and development.Therefore,it is necessary to conduct a comprehensive review of this rapidly evolving topic.Traditional identification methods cannot comprehensively capture the di-versity of gut microbiota.Currently,with the rapid development of molecular biology,the classification and identification methods for gut microbiota have evolved from the initial phenotypic and chemical identi-fication to identification at the molecular level.This review integrates the main methods of gut microbiota identification and evaluates their application.We pay special attention to the research progress on molec-ular biological methods and focus on the application of high-throughput sequencing technology in the iden-tification of gut microbiota.This revolutionary method for intestinal flora identification heralds a new chapter in our understanding of the microbial world.

gut microbiota16S rRNAreal-time fluorescent qPCRhigh-throughput sequencingmass spectrum

王萱、吕昌龙、翟景波

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内蒙古民族大学医学院,内蒙古通辽 028000

延边大学化学生物学研究中心,吉林延吉 133002

人兽共患病防控自治区高等学校重点实验室,内蒙古 通辽 028000

中国医科大学免疫学研究所,沈阳 110000

内蒙古自治区布鲁氏菌病防治工程技术研究中心,内蒙古通辽 028000

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肠道菌群 16S rRNA 实时荧光定量PCR 高通量测序 质谱

国家自然科学基金青年科技人才培养计划(创新团队)人兽共患病防控重点技术研究项目(2023)内蒙古自治区重大科技项目内蒙古自治区自然科学基金内蒙古自治区高等学校人畜共患病防控重点实验室开放基金内蒙古自治区高等学校人畜共患病防控重点实验室开放基金内蒙古自治区高等学校人畜共患病防控重点实验室开放基金

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2024

10.13865/j.cnki.cjbmb.2024.03.1470

中国生物化学与分子生物学报
中国生物化学与分子生物学会 北京大学

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CSTPCD北大核心
影响因子：0.617
ISSN：1007-7626
年,卷(期)：2024.40(8)