中国现代医学杂志2021,Vol.31Issue(22) :33-38.DOI:10.3969/j.issn.1005-8982.2021.22.007

前列腺纤维性增生的差异表达基因筛选及富集研究

Screening and identification of differentially expressed genes in benign prostatic fibrous hyperplasia and the enrichment analysis

万少平 蔡季 肖靓琨
中国现代医学杂志2021,Vol.31Issue(22) :33-38.DOI:10.3969/j.issn.1005-8982.2021.22.007

前列腺纤维性增生的差异表达基因筛选及富集研究

Screening and identification of differentially expressed genes in benign prostatic fibrous hyperplasia and the enrichment analysis

万少平 1蔡季 2肖靓琨3
扫码查看

作者信息

  • 1. 岳阳市人民医院 泌尿外科,湖南 岳阳 414000
  • 2. 织金县人民医院 泌尿外科,贵州 织金 552100
  • 3. 岳阳市人民医院 外科,湖南 岳阳 414000
  • 折叠

摘要

目的 筛选和初步鉴定良性前列腺纤维性增生的差异表达基因(DEGs),发现新的良性前列腺纤维性增生的基因片段,为临床监测和治疗前列腺纤维性增生提供潜在的基因位点和标志物依据.方法 收集前列腺等离子电切术后组织标本,根据标本病理诊断结果,将标本分成纤维组和结节组.标本冷冻保存,分别提取前列腺结节性增生标本和纤维性增生标本的组织总RNA,构建转录组文库,通过二代高通量测序,对两组mRNA进行定量及差异分析,再做差异基因的GO、KEGG、网络互作分析.结果 两组标本总共发现差异表达基因1598个,与结节组相比,纤维组相对表达量上调基因1063个,相对表达量下调基因535个.通过GO富集分析发现,DGEs主要富集在离子转运、细胞黏附、细胞外基质组等生物学过程中,富集在近端启动子DNA结合转录激活剂、RNA聚合酶Ⅱ、DNA结合转录激活剂、信号受体结合等活性分子功能上,以及富集在细胞膜、细胞外区域、质膜等细胞部位.KEGG通路分析发现,DGEs主要富集在细胞外基质-受体作用、细胞因子与细胞因子受体作用等信号通路上.构建DEGs的PPI网络互作筛选出10个重要基因,发现PPBP、OPRM1、GAL 3个基因在前列腺纤维性增生组织中上调.结论 PPBP、OPRM1、GAL等DEGs参与前列腺纤维性增生的发生、发展,可能是良性前列腺纤维性增生监测和治疗的潜在分子标志物.

关键词

良性前列腺增生/结节/纤维/microRNA/差异表达基因

引用本文复制引用

基金项目

湖南省自然科学基金面上项目(2017JJ2259)

出版年

2021
中国现代医学杂志
中南大学,卫生部肝胆肠外科研究中心

中国现代医学杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.927
ISSN:1005-8982
参考文献量2
段落导航相关论文