中国现代医学杂志2022，Vol.32Issue(9) ：25-31.DOI:10.3969/j.issn.1005-8982.2022.09.005

基于二代测序技术ghrelin作用后人卵巢癌细胞差异表达lncRNA的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of differentially expressed lncRNA in human ovarian cancer cells treated with ghrelin based on next-generation sequencing

宋婉莹 萨日盖 高海宁 赵鹏伟
中国现代医学杂志2022，Vol.32Issue(9) ：25-31.DOI:10.3969/j.issn.1005-8982.2022.09.005
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基于二代测序技术ghrelin作用后人卵巢癌细胞差异表达lncRNA的生物信息学分析

Bioinformatics analysis of differentially expressed lncRNA in human ovarian cancer cells treated with ghrelin based on next-generation sequencing

宋婉莹 1萨日盖 1高海宁 2赵鹏伟3
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作者信息

  • 1. 兴安盟人民医院,内蒙古 乌兰浩特 137400
  • 2. 内蒙古医科大学,内蒙古 呼和浩特010059
  • 3. 内蒙古医科大学基础医学院 微生物与免疫学研究室,内蒙古 呼和浩特 010059
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摘要

目的 分析二代测序技术ghrelin作用后的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达.方法 从对照组(不添加ghrelin)和实验组(添加600 ng/mL ghrelin 24 h)的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中分别提取RNA进行测序,筛选出实验组发生差异表达的lncRNA,对其进行靶基因预测并将预测结果与差异mRNA取交集,对取交集后的基因进行GO分析和KEGG通路分析.结果 筛选获得差异表达的lncRNA有236个(上调130个,下调106个);差异表达mRNA有71个(上调66个,下调5个).差异表达lncRNA靶基因与差异表达mRNA取交集筛选获得57个基因.GO和KEGG通路富集分析结果显示:这些差异表达lncRNA主要与精、赖氨酸跨膜转运,氧化应激反应及发育过程相关,并且主要富集在细胞因子受体信号通路、胰高血糖素和胰岛素信号通路及癌症相关信号通路上.结论 ghrelin作用后的人卵巢癌细胞中lncRNA的表达有差异,其可能参与卵巢癌的发生、发展,提示ghrelin可能在卵巢癌治疗中具有重要作用.

关键词

卵巢癌/二代测序技术/ghrelin/长链非编码RNA

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出版年

2022
中国现代医学杂志
中南大学,卫生部肝胆肠外科研究中心

中国现代医学杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.927
ISSN：1005-8982
参考文献量2
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