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基于N基因的小反刍兽疫病毒贵州流行株分子特征与分群研究

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为探讨小反刍兽疫病毒(peste des petits ruminants virus,PPRV)贵州流行株N基因分子特征和分群,试验设计了1对特异性引物,应用RT-PCR技术对小反刍兽疫(peste des petits ruminants,PPR)临床样本进行N基因扩增,克隆至pMD19-T载体,对阳性重组质粒进行测序,应用DANStar软件对测序序列和参考序列进行核苷酸同源性、氨基酸同源性、变异位点及系统进化树分析.结果显示:PPRV贵州流行株N基因扩增长度为1578 bp,其相互间核苷酸、氨基酸同源性分别为99.6％ ～100.0％ 及99.2％ ～100.0％,与国内参考株N基因的核苷酸序列(97.7％ ～99.9％)及氨基酸序列(98.3％ ～100.0％)同源性较国外参考株(88.5％ ～97.7％ 和92.2％ ～98.5％)高;PPRV贵州流行株N基因编码的氨基酸同疫苗株Nigeria 75-1相比存在26个位点突变,但没有氨基酸的缺失或增加;基于N基因系统进化分析显示,PPRV贵州流行株同国内参考株处于同一个进化分支,但与国外参考株处于不同进化分支;其属于病毒进化的Ⅳ基因群,与国内参考株处于同一系统分群,但与疫苗株Nigeria 75-1(Ⅰ基因群)处于不同基因群.
Molecular Characteristics and Cluster of PPRV Guizhou Strains Based on N Gene

王军、杨源、张云丹、文明、周碧君、程振涛、岳筠、李涛

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贵州大学动物科学学院 ,贵阳550025

贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室 ,贵阳550025

贵州省动物疫病预防控制中心 ,贵阳550008

小反刍兽疫病毒(PPRV) N基因 序列分析 基因分群

贵州省科技合作项目贵州省研究生教育创新计划项目贵州省科技创新人才团队项目

黔科合LH字20157674号GZZ2017002黔科合人才团队20154016号

2018

中国畜牧兽医
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

中国畜牧兽医

CSTPCD北大核心
影响因子：0.72
ISSN：1671-7236
年,卷(期)：2018.45(8)
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