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趋化因子受体CXCR4抑制剂的三维定量构效关系及与其受体间的分子对接研究

Study on 3D-QSAR of CXCR4 Receptor Inhibitor and Its Molecular Docking with Their Receptors

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目的:为设计新型趋化因子受体CXCR4抑制剂提供参考.方法:从文献中收集38个CXCR4受体抑制剂的结构与活性数据[半数抑制浓度(IC50)],使用Sybyl-X 2.0软件,运用第二代比较分子场法(即Topomer CoMFA),构建CXCR4受体抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,使用18个样本的测试集验证模型的外部预测能力,并针对CXCR4受体抑制剂与CXCR4受体的立体场与静电场进行分析各R基团的取代基与活性的关系;使用Sybyl-X 2.0软件进行分子对接,分析CXCR4受体抑制剂与CXCR4受体之间的相互关键作用.结果:所得Topomer CoMFA模型的交叉验证系数Q2=0.735,拟合验证系数R2=0.959,Fisher验证值F=416.4,经过分子切割后和三维等势图分析,在R1基团的末端的取代基加入大体积且正电性强的基团有利于活性的提高;在R2基团附近引入体积较大且负电性较强的取代基有利于活性的提高;R3基团附近引入体积小及正电性强的取代基有利于活性的提高.分子对接结果显示,CXCR4受体抑制剂与Asp97、Glu288和Trp94等关键氨基酸残基有相互作用.结论:构建的Topomer CoMFA模型具有良好的预测能力和统计学稳定性,CXCR4受体抑制剂与受体靶标蛋白之间具有较强的氢键作用.3D-QSAR和分子对接研究结果可为CXCR4受体抑制剂分子的设计、改造及药物研发提供参考.

黄闽辉、徐俊、李雨静、马伟峰

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南方医科大学公共卫生学院,广州 510000

暨南大学药学院,广州510000

新型趋化因子受体CXCR4 三维定量构效关系 分子对接

广东省产业技术研究与开发专项资金项目

2013B021800040

2018

中国药房
中国医院协会,中国药房杂志社

中国药房

CSTPCD北大核心
影响因子：0.956
ISSN：1001-0408
年,卷(期)：2018.29(21)
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