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系统性红斑狼疮基因表达差异分析及治疗中药预测

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目的:基于生物信息学的方法分析系统性红斑狼疮(SLE)患者与正常人的差异表达基因(DEGs),并预测潜在的治疗中药.方法:利用edgeR分析数据集GSE154851,获得DEGs,通过String构建蛋白互作(PPI)网络,使用Cytoscape的CytoHubba插件筛选关键基因,并进行GO功能及KEGG信号通路富集分析.将关键基因输入到Coremine Medical数据库筛选潜在治疗中药.结果:筛选出228个DEGs,其中有196个基因表达上调,32个基因表达下调.筛选到的关键基因有DDX58、ISG15、STAT1、TRIM25、IRF7、IFIH1、NOD2、UBE2L6、NOD1、FLT3,GO分析显示关键基因参与的主要生物过程包括调节IFN-I、TNF、IL-6的产生,对病毒的应答等;KEGG分析显示主要涉及的信号通路有RIG-I-样受体信号通路、甲型流感、EB病毒感染等.预测出治疗SLE的潜在中药有水牛角、赤芍、鳖甲、半夏、板蓝根、黄柏、独活、厚朴等.结论:本研究通过分析SLE的基因表达数据,获得DEGs,从而筛选了治疗SLE的关键基因以及潜在的治疗药物,为探索治疗SLE的药物选择提供了新思路.
Analysis of Differentially Expressed Genes in Systemic Lupus Erythematosus and Prediction of Therapeutic Traditional Chinese Medicine

刘瑞、曹双、张秋月、阴志刚、范长有、田花丽、黄冉涛

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南阳市科学院,河南 南阳473000

南阳市农业科学院,河南 南阳473000

系统性红斑狼疮 生物信息学 差异表达基因 关键基因 中药预测

2022

中国医药导刊
国家食品药品监督管理局信息中心

中国医药导刊

影响因子：1.408
ISSN：1009-0959
年,卷(期)：2022.24(8)
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