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不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落结构变化及其多样性分析

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目的:研究不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落结构及其多样性,为阐释丹参连作障碍的形成提供理论依据.方法:分别采集未种植丹参(CK)、种植1年(Y1)及种植2年(Y2)的根际土壤,基于Illumina公司Miseq高通量测序平台,进行细菌16S rRNA序列V3-V4区的高通量测序,对不同连作年限山地丹参根际土壤细菌群落结构及其多样性分析进行研究.结果:CK、Y1及Y2处理中分别得到28 205、13 847及9 296条有效序列,注释为3 832、1 989及1 295种细菌操作分类单元(OTU),其中随着连作年限的增加,根际土壤细菌群落的种类及多样性均呈现下降趋势.在细菌门分类水平上,3个处理土壤中主要优势菌群落为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和细菌变形菌门(Proteobacteria);在纲分类水平上优势菌株相差较大,CK及Y2中所占比例最大的为拟杆菌纲(Bacteroidia),分别为26.40%及38.90%,Y1中所占比例最大的为芽孢杆菌纲(Bacilli),为25.06%;在目分类水平上优势菌株相差明显,CK和Y2中所占比例最大为拟杆菌目(Bacteroidales),分别为26.40%和38.90%,Y1中梭菌目(Clostridiales)所占比例最大,为18.42%.结论:不同连作年限山地丹参根际土壤CK及Y1采集的根际土壤细菌在属水平上群落结构具有更高的相似性,Y2中的土壤细菌群落多样性降低,以期为促进丹参种植、揭示连作障碍形成提供一定的理论基础.
Diversity analysis and characteristic of bacterial community in rhizosphere soil of Salvia miltiorrhiza Bge.in different continuous cropping years

周冰谦、赵恒强、王晓、卢恒、郭兰萍、刘伟、李奉胜、史国玉

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齐鲁工业大学(山东省科学院),山东省分析测试中心,山东省中药质量控制技术重点实验室,济南250014

中国中医科学院中药资源中心,中国中医科学院博士后科研流动站,北京100700

莱芜紫光生态园有限公司,莱芜271100

山东医学高等专科学校,济南250002

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丹参 根际土壤 细菌群落 连作障碍 多样性 高通量测序

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No.2017YFC1700703No.2017YFC1702701CARS-21No.2016GSF202011No.2018GNC110040No.ZR2017LH069No.ZR2017LH071No.J17KA261

2019

中华中医药杂志
中华中医药学会

中华中医药杂志

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.135
ISSN:1673-1727
年,卷(期):2019.34(9)
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