摘要
目的 为寻找支气管哮喘患者潜在的诊断生物标志物,基于生物信息学分析方法.方法 从基因表达芯片(GEO)数据库获得以哮喘患者和健康志愿者为试验对象的GSE41861和GSE64913支气管上皮细胞基因表达数据集.通过对高通量芯片数据进行提取,结合GEO2R、omics Bean、STRING等网站或软件筛选差异表达基因,将二者的共同差异基因排列成蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络,从而找到关键基因.在DAVID网站中进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,以探索这些基因的功能作用.最后应用ROC曲线分析这些基因对支气管哮喘的诊断价值.结果 GSE41861和GSE64913数据集中共筛选出11个关键差异基因.GO富集分析显示,差异基因主要与内肽酶、肽酶的活性及调节相关,KEGG结果显示上述差异基因涉及到的信号通路为补体及凝血级联反应.根据ROC曲线显示CEACAM5、GRP、SCGB3Al,KCNA1诊断哮喘的准确度较高(AUC值＞0.8).结论 哮喘的生物信息学分析结果为探索哮喘的潜在发病机制和关键基因提供证据.其中CEACAM5、GRP、SCGB3A1、KCNA1与哮喘的临床诊断具有意义.
维普
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