摘要
目的 评价宏基因组二代测序(mNGS)技术在社区获得性肺炎(CAP)病原体检测中的应用价值.方法 回顾性分析2021年2月至8月于浙江大学医学院附属第一医院临床诊断为CAP并行mNGS检测及实验室常规方法检查的345例住院患者的临床资料.记录每位患者的人口学特征、mNGS检测与实验室常规方法检查的结果、抗感染方案和调整方案前后C反应蛋白(CRP)及降钙素原(PCT)水平.结果 实验室常规方法检测为阳性的患者有173例,发现33种微生物;mNGS检测为阳性患者共315例,发现130种微生物.mNGS检测阳性率较实验室常规方法显著提高[91.30％(315/345)vs.50.14％(173/345),x2=129.097,P＜0.001],一致性检验Kappa=0.105,P=0.001.且在抗生素暴露的294例患者中,mNGS阳性率显著高于实验室常规方法[90.48％(266/294)vs.49.32％(145/294),x2=109.924,P＜0.001].同时,mNGS 与实验室常规方法确诊率的比较,差异具有统计学意义[85.22％(294/345)vs.39.13％(135/345),x2=141.040,P＜0.001].与入院时比较,调整抗感染方案后3 d,基于mNGS检测结果作为病原学诊断依据的患者CRP[68(24,118)mg/L vs.12(5,46)mg/L,Z=6.154,P＜0.001]及 PCT[0.53(0.20,0.93)μg/L vs.0.25(0.08,0.54)μg/L,Z=2.572,P=0.010]水平均显著降低.结论 在CAP患者病原学的检测中,mNGS技术具有既往抗生素暴露的影响少、检测病原体广泛等优点,可以作为一种可行的补充手段.
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