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青海省部分地区马铃薯Y病毒cp基因序列分析

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马铃薯Y病毒(PVY)是危害我国马铃薯的主要病毒之一,其在自然条件下极易发生基因变异而产生株系分化现象.为揭示青海马铃薯Y病毒分离物cp基因的分子变异,利用RT-PCR方法扩增获得了16个马铃薯Y病毒分离物的cp基因序列,采用SDT、DANMAN、RDP和MEGA软件对其进行分子变异分析.序列一致率结果表明,16个分离物的核苷酸序列均为801个碱基,一致率为98.0％ ～100％,编码267个氨基酸,一致率为94.8％ ～100％.重组分析表明,16个分离物未发生基因重组.系统发育分析发现,11个分离物与PVYN-Wi株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVYN-Wi株系的亲缘关系最近,占被检出病毒分离物的68.7％;另外5个分离物与PVYO株系相聚成簇,表明其在系统发育关系上与PVYO株系亲缘关系最近;未发现PVYC株系、PVYN株系、PVYE株系和PVYNTN株系存在.
Analysis on cp gene sequences of potato virus Y from some places in Qinghai Province

程亮

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青海省农林科学院 植物保护研究所,青海省农业有害生物综合治理重点实验室,青海 西宁 810016

青海大学,省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海 西宁 810016

马铃薯Y病毒 cp基因 序列分析 最大似然法 青海

青海省自然科学基金青海大学中青年科研项目

2018-ZJ-9172014-QNY-7

2019

浙江农业学报
浙江省农业科学院 浙江省农学会

浙江农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.765
ISSN：1004-1524
年,卷(期)：2019.31(11)
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