中国现代医生2024,Vol.62Issue(7) :9-12.DOI:10.3969/j.issn.1673-9701.2024.07.003

NGS自动化平台在HLA基因分型的建立及应用

Establishment and application of automated platform for NGS experiment in HLA genotyping

何亿镇 王芳 董丽娜 陈晨 章伟
中国现代医生2024,Vol.62Issue(7) :9-12.DOI:10.3969/j.issn.1673-9701.2024.07.003

NGS自动化平台在HLA基因分型的建立及应用

Establishment and application of automated platform for NGS experiment in HLA genotyping

何亿镇 1王芳 2董丽娜 2陈晨 2章伟2
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作者信息

  • 1. 浙江中医药大学医学技术与信息工程学院,浙江杭州 310053;浙江省血液中心输血医学研究所,浙江杭州 310052
  • 2. 浙江省血液中心输血医学研究所,浙江杭州 310052
  • 折叠

摘要

目的 建立基于二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术对人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)基因进行分型的自动化操作平台,并评估其在HLA常规检测中的应用.方法 根据试剂盒操作说明编写相应的计算机程序,利用Hamilton Microlab STARlet全自动液体处理工作站联合96通道小型液体工作站、荧光化学发光分析仪等仪器,实现NGS技术对HLA基因分型过程中文库制备步骤的自动化操作.结果 手工法和自动化平台获取的文库片段两者读长基本一致,浓度及质量均符合要求,测序结果一致;而自动化平台操作时间明显少于手工操作.结论 建立的NGS自动化操作平台检测HLA基因分型方法可行,值得推广使用.

关键词

人类白细胞抗原/二代测序/自动化平台

Key words

Human leucocyte antigen/Next-generation sequencing/Automated platform

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基金项目

浙江省医药卫生科技计划项目(2023KY659)

出版年

2024
中国现代医生
中国医学科学院

中国现代医生

影响因子:1.571
ISSN:1673-9701
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