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香蕉NPR1基因家族的鉴定及在枯萎病菌胁迫下表达分析

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以拟南芥NPR1基因家族成员蛋白序列为查询序列,在香蕉基因组数据库中鉴定香蕉NPR1基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及在枯萎病菌侵染下的表达分析.共鉴定得到15个成员,将其命名为MaNPR1～MaNPR15.理化性质、保守功能结构域、重要的氨基酸残基及motif分析结果与其他物种所报道的有较高的一致度.香蕉NPR1基因家族成员种内进化树、基因结构及结构域的分类情况呈现出高度一致,表明了香蕉NPR1基因家族成员间有着明确的分工.种间进化树显示香蕉的NPR1基因分为3个分组,每个分组都含有拟南芥NPR1成员.主栽品种巴西蕉(Musa acuminata Colla.AAA group‘ Brazilian’)易感香蕉枯萎病,从巴西蕉CK及巴西蕉受枯萎病侵染2d的根系转录组数据中综合表达量及表达趋势选定8个成员,并在巴西蕉与抗(耐)Foc TR4品种GCTCV-119中验证其表达模式.基因MaNPR4及MaNPR11在抗感品种中表现出明显的差异表达,在抗病品种GCTCV-119中随着Foc TR4侵染时间延长表达量不断增加,而在感病品种巴西蕉中表达量呈下降趋势.表明MaNPR4及MaNPR11参与香蕉抗枯萎病过程.本研究结果为进一步利用香蕉NPR1基因进行香蕉抗枯萎病遗传改良奠定基础.
Genome-Wide Survey of the NPR1 Gene Family in Banana (Musa spp.) and Expression Pattern Analysis Upon Infection with Foc TR4

任陪娣、谢碧玉、陈翠、贾彩红、王静毅、张建斌、徐碧玉、王卓、金志强

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中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带生物技术重点开放实验室,海口571101

南京农业大学园艺学院,南京210095

香蕉 NPR1 生物信息学分析 香蕉枯萎病 表达分析

国家自然科学基金海南省自然科学基金资助项目现代农业产业技术体系

31501624318MS090CARS-32

2019

植物遗传资源学报
中国农业科学院作物科学研究所　中国农学会

植物遗传资源学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.415
ISSN：1672-1810
年,卷(期)：2019.20(6)
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