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水稻种子耐厌氧萌发全基因组关联分析

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本研究通过解析水稻芽期耐淹性的遗传基础,挖掘相关QTL,筛选优良单株,为分子标记辅助育种提供优异种质和理论支撑.选取318份国内外水稻种质资源,在正常有氧和厌氧条件下测定种子萌发期的胚芽鞘长度,并计算相对胚芽鞘长度,通过整合基因型和表型数据进行全基因组关联分析.318份水稻种质间相对胚芽鞘长度差异明显,相对胚芽鞘长度的平均值为-0.238,中位值为-0.342,最低值为-0.923,最高值为3.069.全基因组关联分析共鉴定到83个SNP与种子耐厌氧萌发性状显著相关.通过合并距离较近的SNP,共鉴定到27个耐厌氧萌发QTL,3个QTL与已报道的耐厌氧萌发QTL位置相近.其中qAG4-2与耐厌氧萌发性状的关联度较高,共有20个候选基因位于qAG4-2内,其中1个基因在厌氧条件下相对于正常有氧条件上调表达,2个基因下调表达.本研究挖掘的控制水稻耐厌氧萌发的QTL及优异种质资源将为水稻耐厌氧育种提供重要支撑.
Genome Wide Association Study of Anaerobic Germination Tolerance in Seeds of Rice Accessions

刘利成、李小湘、黎用朝、潘孝武、闵军、刘三雄、刘文强、胡敏、段永红、余亚莹、张海清

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湖南农业大学农学院,长沙410128

湖南省农业科学院水稻研究所/农业部长江中下游籼稻遗传育种重点实验室,长沙410125

水稻 厌氧萌发 全基因组关联分析

国家现代农业产业技术体系建设专项

CARS-01-14

2021

10.13430/j.cnki.jpgr.20210425002

植物遗传资源学报
中国农业科学院作物科学研究所　中国农学会

植物遗传资源学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.415
ISSN：1672-1810
年,卷(期)：2021.22(6)
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