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花生TCP转录因子的全基因组鉴定及组织表达特性分析

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TCP基因家族是植物中一类重要的转录因子,参与植物整个生长发育阶段的调控,尤其在花器官和分生组织中发挥重要作用.目前,在花生中尚无TCP相关基因的报道.为研究花生各TCP转录因子的生物调控作用,以及为进一步分析花生TCP基因提供参考信息,利用生物信息学方法在全基因组水平对花生TCP家族基因进行鉴定,分析其染色体定位、系统进化、基因结构、保守基序和基因表达模式.结果分别从花生野生种和栽培种鉴定出19个和32个TCP基因,不均匀分布在9个野生种染色体和14个栽培种染色体上.系统进化分析表明,51个花生TCP基因可划分为亚家族Ⅰ(PCF)和亚家族Ⅱ两个亚类,其中亚家族Ⅱ包括2个分支,CIN和CYC/TB1.这些基因都含有高度保守的bHLH结构域,但其内含子结构存在较大差异,内含子数量及长度分布与基因的系统进化有较大关系,其中亚家族Ⅰ成员的内含子较少,亚家族Ⅱ内含子较多,且长度差异较大.表达谱分析显示,仅有7个基因在各组织中呈现显著差异性表达,其中有6个基因的差异表达与分生组织和花器官有关,推测其在花生茎尖和花的生长发育过程中起重要作用.
Genome-Wide Identification and Characteristic Analyzation of the TCP Transcription Factors Family in Peanut

王通、赵孝东、甄萍萍、陈静、陈明娜、陈娜、潘丽娟、王冕、许静、禹山林、迟晓元、张建成

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山东省花生研究所/农业农村部花生生物学与遗传育种重点实验室,266100,山东青岛

临沂市农业科学院,276012,山东临沂

德州市临邑县农业农村局,251500,山东德州

花生 TCP转录因子 全基因鉴定 基因表达

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2021

10.16035/j.issn.1001-7283.2021.02.005

作物杂志
中国作物学会 中国农科院作物科学研究所

作物杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.821
ISSN：1001-7283
年,卷(期)：2021.(2)
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