作物杂志2022，Issue(1) ：77-83.DOI:10.16035/j.issn.1001-7283.2022.01.011

苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of FtC4H Gene from Tartary Buckwheat

尹桂芳 段迎 杨晓琳 蔡苏云 王艳青 卢文洁 孙道旺 贺润丽 王莉花
作物杂志2022，Issue(1) ：77-83.DOI:10.16035/j.issn.1001-7283.2022.01.011
✕
  • 维普
  • 万方数据

苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of FtC4H Gene from Tartary Buckwheat

尹桂芳 1段迎 2杨晓琳 2蔡苏云 2王艳青 1卢文洁 1孙道旺 1贺润丽 2王莉花1
扫码查看

作者信息

  • 1. 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,650205,云南昆明
  • 2. 山西中医药大学中药与食品工程学院,030619,山西太原
  • 折叠

摘要

克隆苦荞苯丙烷类物质代谢途径中的关键酶肉桂酸-4-羟基化酶基因(FtC4H),为进一步研究其功能奠定基础.以云荞1号和小米荞为材料,提取不同发育期果壳RNA,利用RT-PCR法克隆苦荞FtC4H基因,运用生物信息学分析FtC4H蛋白的特征,构建FtC4H蛋白系统进化树,分析其基因表达.结果 表明,克隆的FtC4H基因序列包含1299bp完整的cDNA开放阅读框,编码432个氨基酸,为亲水性不稳定碱性蛋白,具有P450超家族保守域,不具有跨膜结构域,有丰富的二级结构,三级结构预测显示FtC4H与6vby.1.A的序列相似度高.系统进化分析结果表明,本研究克隆的FtC4H与已报道的苦荞其他C4H基因不同.qRT-PCR结果表明,FtC4H在小米荞的花和叶中相对表达量显著高于云荞1号.

关键词

苦荞/RT-PCR克隆/肉桂酸-4-羟基化酶/生物信息学分析/实时荧光定量PCR

引用本文复制引用

基金项目

国家自然科学基金地区科学基金(31460379)

财政部和农业部:国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-07-C-2)

山西省重点研发计划(201803D221012-6)

2019年中医药公共卫生服务补助专项全国中药资源普查项目(财社[2019]68号)

出版年

2022
作物杂志
中国作物学会 中国农科院作物科学研究所

作物杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.821
ISSN：1001-7283
被引量2
参考文献量9
段落导航相关论文