苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of FtC4H Gene from Tartary Buckwheat

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中文摘要：克隆苦荞苯丙烷类物质代谢途径中的关键酶肉桂酸-4-羟基化酶基因(FtC4H),为进一步研究其功能奠定基础.以云荞1号和小米荞为材料,提取不同发育期果壳RNA,利用RT-PCR法克隆苦荞FtC4H基因,运用生物信息学分析FtC4H蛋白的特征,构建FtC4H蛋白系统进化树,分析其基因表达.结果表明,克隆的FtC4H基因序列包含1299bp完整的cDNA开放阅读框,编码432个氨基酸,为亲水性不稳定碱性蛋白,具有P450超家族保守域,不具有跨膜结构域,有丰富的二级结构,三级结构预测显示FtC4H与6vby.1.A的序列相似度高.系统进化分析结果表明,本研究克隆的FtC4H与已报道的苦荞其他C4H基因不同.qRT-PCR结果表明,FtC4H在小米荞的花和叶中相对表达量显著高于云荞1号.

作者：

尹桂芳、段迎、杨晓琳、蔡苏云、王艳青、卢文洁、孙道旺、贺润丽、王莉花

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作者单位：

云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,650205,云南昆明

山西中医药大学中药与食品工程学院,030619,山西太原

关键词：

苦荞 RT-PCR克隆肉桂酸-4-羟基化酶生物信息学分析实时荧光定量PCR

基金：

国家自然科学基金地区科学基金财政部和农业部:国家现代农业产业技术体系建设项目山西省重点研发计划2019年中医药公共卫生服务补助专项全国中药资源普查项目

项目编号：

31460379CARS-07-C-2201803D221012-6财社[2019]68号

出版年：

2022

DOI：

10.16035/j.issn.1001-7283.2022.01.011

作物杂志

中国作物学会中国农科院作物科学研究所

作物杂志

CSTPCD北大核心

影响因子：0.821

ISSN：1001-7283

年,卷(期)：2022.(1)

被引量2
参考文献量9