作物杂志2022,Issue(3) :73-79.DOI:10.16035/j.issn.1001-7283.2022.03.010

苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析

Molecular Cloning and Bioinformatics Analyzing of Laccase in Fagopyrum tataricum

杨晓琳 段迎 蔡苏云 贺润丽 尹桂芳 王艳青 卢文洁 孙道旺 王莉花
作物杂志2022,Issue(3) :73-79.DOI:10.16035/j.issn.1001-7283.2022.03.010

苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析

Molecular Cloning and Bioinformatics Analyzing of Laccase in Fagopyrum tataricum

杨晓琳 1段迎 1蔡苏云 1贺润丽 1尹桂芳 2王艳青 2卢文洁 2孙道旺 2王莉花2
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作者信息

  • 1. 山西中医药大学中药与食品工程学院,030619,山西太原
  • 2. 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,650221,云南昆明
  • 折叠

摘要

利用RT-PCR技术从苦荞中克隆出2条漆酶(laccase)基因,运用生物信息学技术对2个基因序列进行分析,预测结构域、二级和三级蛋白结构,进行蛋白同源比对及进化树分析.结果表明,FtLAC-1基因序列开放阅读框为1695bp,编码564个氨基酸,FtLAC-2基因序列开放阅读框为1707bp,编码568个氨基酸.FtLAC-1和FtLAC-2蛋白预测分子量分别为61.41和62.47kDa,理论等电点分别为9.45和9.41,为亲水性蛋白,2个基因序列相似性较低,氨基酸序列同源性不高.qRT-PCR分析出其在苦荞不同组织器官存在差异性表达.结论为进一步探索FtLAC-1和FtLAC-2在苦荞薄果壳形成中的功能提供理论基础.

关键词

苦荞/漆酶/基因克隆/生物信息学/表达分析

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基金项目

国家自然科学基金地区科学基金(31460379)

国家现代农业产业技术体系项目(CARS-07-C-2)

山西省重点研发计划(201803D221012-6)

山西省自然科学研究面上项目(20210302123231)

校级科技创新能力培育计划(2020PY-YC-16)

出版年

2022
作物杂志
中国作物学会 中国农科院作物科学研究所

作物杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:0.821
ISSN:1001-7283
参考文献量15
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