作物杂志2022，Issue(4) ：37-45.DOI:10.16035/j.issn.1001-7283.2022.04.006

基于转录组数据的生姜ZoWRKY基因家族鉴定及逆境响应分析

Identification and Expression Analysis of the ZoWRKY Family in Stress Responses Based on Transcriptome Data of Ginger(Zingiber officinale Roscoe)

姜玉松 李洪雷 李哲馨 徐晓玉 李隆云 黄孟军
作物杂志2022，Issue(4) ：37-45.DOI:10.16035/j.issn.1001-7283.2022.04.006
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基于转录组数据的生姜ZoWRKY基因家族鉴定及逆境响应分析

Identification and Expression Analysis of the ZoWRKY Family in Stress Responses Based on Transcriptome Data of Ginger(Zingiber officinale Roscoe)

姜玉松 1李洪雷 2李哲馨 2徐晓玉 3李隆云 4黄孟军5
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作者信息

  • 1. 西南大学资源环境学院,400715,重庆;重庆文理学院特色植物研究院,402160,重庆
  • 2. 重庆文理学院特色植物研究院,402160,重庆
  • 3. 西南大学资源环境学院,400715,重庆
  • 4. 重庆市中药研究院中药生药研究所,400065,重庆
  • 5. 西南大学资源环境学院,400715,重庆;重庆文理学院特色植物研究院,402160,重庆;重庆市中药研究院中药生药研究所,400065,重庆
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摘要

WRKY是一类植物特有的转录因子家族,每个成员都含有高度保守的WRKY结构域,广泛参与植物的生长发育、信号传导和逆境胁迫应答等过程.本研究基于生姜转录组数据鉴定了ZoWRKY家族成员.结果显示,在340.2Mb的生姜转录组数据中,共获得78个具有ORF序列的ZoWRKY家族成员,分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ 3个亚族,其中亚族Ⅱ又分为Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e.逆境响应表达分析显示,分布在Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅲ等的21 个ZoWRKY响应土壤湿度,而分布在Ⅰ、Ⅱ-a和Ⅱ-c等的19个ZoWRKY响应青枯菌侵染,推测ZoWRKY在生姜逆境响应中具有重要功能.对后续开展生姜WRKY的研究、促进抗性育种和提高产量具有重要意义.

关键词

生姜/WRKY/转录因子/逆境响应

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基金项目

国家自然科学基金青年科学基金(31501273)

中国博士后科学基金(2021M700623)

重庆市教育委员会科技项目(KJZD-K201801301)

重庆市教育委员会科技项目(KJQN202001337)

重庆市自然科学基金(cstc2020jcyj-msxmX0925)

重庆市自然科学基金(cstc2019jcyj-msxmX0697)

出版年

2022
作物杂志
中国作物学会 中国农科院作物科学研究所

作物杂志

CSTPCD北大核心
影响因子：0.821
ISSN：1001-7283
参考文献量8
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