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癫痫发作的新皮质中差异表达基因生物信息分析

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目的 对尼古丁诱导癫痫发作新皮质中发现的差异表达基因(DEGs)进行生物信息学分析.方法 利用DAVID 6.8和STRING 11.0等分析平台对基因芯片公共数据库(GEO)发表的尼古丁诱导癫痫发作的新皮质筛选DEGs,并进行基因本体(GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析和蛋白质相互作用网络构建.结果 癫痫发作新皮质中发现的DEGs与癫痫致病性基因构建网络,结果共筛选出95个上调基因及119个下调基因,DEGs主要富集于胞嘧啶上的DNA甲基化、DNA复制偶联的核小体组装、细胞凋亡过程的调控等生物学过程,以及刺激神经组织的配体受体相互作用通路、核转录因子(NF-κB)信号通路等.结论 尼古丁诱导癫痫发作新皮质相比正常新皮质的DEGs存在明显差异.多个信号通路、多个蛋白质相互作用方式为理解癫痫发作新皮质病理过程提供了帮助.
Bioinformatics Analysis of Differentially Expressed Genes in the Neocortex of Epileptic Seizures

彭金香、吴沣

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癫痫 新皮质 差异表达基因 生物信息学 富集分析

B2018430

2021

10.12102/j.issn.1672-1349.2021.13.009

中西医结合心血管病电子杂志

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ISSN：
年,卷(期)：2021.19(13)
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