基于简化基因组测序的黑眶蟾蜍遗传多样性分析

Genetic Diversity Analysis of Bufo melanostictus by Reduced-Representation Sequencing

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中文摘要：目的:探究黑眶蟾蜍的遗传多样性水平和遗传结构,以期为蟾酥基原鉴定、种质评价以及资源保护和利用等方面提供理论依据.方法:采用高通量测序技术,对黑眶蟾蜍9个地理种群共54个体进行简化基因组测序,挖掘其单核苷酸多态性位点,分析其遗传多样性和遗传结构.结果:基于获得的10 724个高质量单核苷酸多态性位点分析发现,黑眶蟾蜍的9个地理种群的期望杂合度值(He)为0.2167～0.5870,观测杂合度值(Ho)为0.2803～0.7118,核苷酸多样性为0.1461～0.1825.分子方差分析表明,种群遗传差异主要来源于个体间,且差异达显著水平(P＜0.05).系统进化树、主成分分析与种群遗传结构分析均将样品聚成2个不同的遗传类群.结论:该研究在基因组水平确定了黑眶蟾蜍的遗传分化关系,为今后优质品种选育以及蟾酥道地性形成的分子机制积累了研究基础.

作者：

张云、蔡波、王波、周蓓、刘静、梁肖彩、黄勇

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作者单位：

广西中医药大学,广西南宁530200

中国科学院成都生物研究所,四川成都610041

广西渌金生态科技有限公司,广西南宁530028

关键词：

黑眶蟾蜍高通量测序蟾酥单核苷酸多态性遗传结构

基金：

国家自然科学基金广西自然科学基金广西自然科学基金广西自然科学基金

项目编号：

314605592019GXNSFAA2450842019GXNSFAA2450922020GXNSFAA238017

出版年：

2022

DOI：

10.13863/j.issn1001-4454.2022.01.010

中药材

国家食品药品监督管理局,中药材信息中心站

中药材

CSTPCD北大核心

影响因子：0.913

ISSN：1001-4454

年,卷(期)：2022.45(1)

参考文献量5