摘要
目的:克隆红腺忍冬Lonicera hypoglauca Miq.的MYB基因并对其进行生物信息学及其功能分析.方法:以转录组测序获得的MYB基因序列进行引物设计,采用qRT-PCR方法克隆MYB基因全长;通过在线软件及工具对该基因所编码的氨基酸序列进行生物信息学分析.比较不同浓度PEG6000胁迫处理24 h后的植株叶片MYB基因表达模式,并与相对应的叶片含水量、叶绿素含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性和可溶性蛋白质含量4个生理指标的变化进行相关分析.结果:成功获得MYB基因编码区全长909 bp,编码一个由302个氨基酸组成的蛋白质;DNA结合区域位于N端,长53个氨基酸残基,形成3个螺旋,其中含有两个间距为19个氨基酸残基的色氨酸;这段区域的第3个螺旋含有MYBR1转录因子CCA1-like/R-R亚族的特征模块SHAQKYF;该基因受到PEG诱导调节,其相对表达量随着PEG处理浓度的升高而增加,并与叶片中的含水量、叶绿素含量、可溶性蛋白质含量和SOD酶活性相关系数分别为-0.6964、-0.9132、-0.3714和0.1483.结论:克隆获得预期的红腺忍冬LhMYB1基因,并确认此基因参与了植株的干旱胁迫生理响应,该研究为今后深入开展红腺忍冬耐旱优良品质的研究奠定了基础.
基金项目
国家自然科学基金(31760422)
广西自然科学青年科学基金(2018GXNSFBA281144)
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