中药材2022,Vol.45Issue(10) :2340-2345.DOI:10.13863/j.issn1001-4454.2022.10.010

连翘FsUGT83A1基因的克隆、生物信息学和表达分析

Cloning,Bioinformatic and Expression Analysis of FsUGT83A1 Gene in Forsythia suspensa

金宗元 赵娟娟 张全玲 吴娜娜 王建华 房信胜
中药材2022,Vol.45Issue(10) :2340-2345.DOI:10.13863/j.issn1001-4454.2022.10.010

连翘FsUGT83A1基因的克隆、生物信息学和表达分析

Cloning,Bioinformatic and Expression Analysis of FsUGT83A1 Gene in Forsythia suspensa

金宗元 1赵娟娟 1张全玲 1吴娜娜 1王建华 1房信胜1
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作者信息

  • 1. 山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安 271018
  • 折叠

摘要

目的:克隆连翘糖基转移酶基因FsUGT83A1,并对其进行生物信息学和组织表达分析,了解其与连翘苷合成的相关性.方法:基于连翘基因组和转录组数据,利用RT-PCR扩增FsUGT83A1全长cDNA并进行生物信息学分析;运用实时荧光定量PCR检测基因在不同组织中的表达;采用HPLC测定成分在不同组织中的含量.结果:FsUGT83A1基因的蛋白质编码区(CDS)全长为1365 bp,编码一个由454个氨基酸组成的蛋白,该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,亚细胞定位主要在细胞质中.多序列比对分析表明,该基因具有UGT特有的保守序列PSPG-box;系统进化分析表明,FsUGT83A1与拟南芥UGT83A1聚在一个亚家族,与同科植物油橄榄UGT83A1的同源性最高.该基因在叶中的表达显著高于花、果等组织.HPLC定量分析表明,连翘苷在叶中的含量显著高于其他组织.FsUGT83A1的组织表达与连翘苷的组织分布具有显著相关性,推测该基因可能是调控连翘苷糖基化合成过程的功能基因.结论:FsUGT83A1为首次从连翘中克隆得到的UGT基因,为进一步研究该基因的功能及调控机制提供了研究基础.

关键词

连翘/UGT/基因克隆/生物信息学分析/组织表达

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基金项目

山东省重点研发计划项目(2016GSF202017)

山东省现代农业产业技术体系项目(SDAIT-20-04)

出版年

2022
中药材
国家食品药品监督管理局,中药材信息中心站

中药材

CSTPCD北大核心
影响因子:0.913
ISSN:1001-4454
被引量1
参考文献量5
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