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基于高通量测序分析苗药血人参根和根瘤内生菌的多样性

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目的:探究血人参根和根瘤内生细菌的组成差异,筛选优势内生菌菌株.方法:通过对16S rRNA基因进行高通量测序,对血人参根及根瘤中内生菌进行物种注释、分类、物种多样性和组间差异分析.结果:血人参根和根瘤内生菌总计含有5 574个OTU,隶属于30门79纲192目324科587属.根部的内生菌总计有5 518个OTU,在门分类水平上相对丰度较高的主要为变形菌门Proteobacteria、放线菌门Actinobacteriota,在属水平上相对丰度较高的为游动放线菌属Actinoplanes和norank_f_Kineosporiaceae属,其平均相对丰度分别为18.60％、10.05％;根瘤中内生菌总计有895个OTU,在门分类水平上相对丰度较高的为变形菌门Proteobacteria,在属水平上慢生根瘤菌属Bradyrhizobium占据绝对优势,其平均相对丰度为97.87％.血人参根瘤中内生菌的Shannon、ACE及Chao指数均显著低于根中(P＜0.05).根瘤内参与氨基酸的转运和代谢,细胞的复制、重组和修复,细胞的生物发生等功能菌群相对丰度较高.结论:血人参根瘤中内生菌以埃氏慢生根瘤菌和大豆慢生根瘤菌为主,且与根部相比,物种多样性水平低、群落结构更为单一、物种分布不均匀.

成婷婷、朱攀攀、周涛、张永萍、王崇敏、李军

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贵州中医药大学中药民族药资源研究院,贵州贵阳 550025

贵州中医药大学药学院,贵州贵阳 550025

血人参 根部内生菌 16S rRNA高通量测序 微生物多样性 慢生根瘤菌

国家自然科学基金联合基金贵州省科技计划

U1812403黔科合后补助[2020]3003

2024

10.13863/j.issn1001-4454.2024.01.006

中药材
国家食品药品监督管理局,中药材信息中心站

中药材

CSTPCD北大核心
影响因子：0.913
ISSN：1001-4454
年,卷(期)：2024.47(1)
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