遵义医学院学报2019，Vol.42Issue(1) ：35-44.

海洋放线菌Streptomyces koyangensis SCSIO 5802中多烯大环内酯类抗生素candicidin生物合成基因簇的分析鉴定

Identification of biosynthetic gene cluster of polyene marcrolide antibiotic candicidin from marine-derived Streptomyces koyangensis SCSIO 5802

涂佳佳 鞠建华 付少彬 李青连
遵义医学院学报2019，Vol.42Issue(1) ：35-44.
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海洋放线菌Streptomyces koyangensis SCSIO 5802中多烯大环内酯类抗生素candicidin生物合成基因簇的分析鉴定

Identification of biosynthetic gene cluster of polyene marcrolide antibiotic candicidin from marine-derived Streptomyces koyangensis SCSIO 5802

涂佳佳 1鞠建华 2付少彬 3李青连2
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作者信息

  • 1. 遵义医科大学药学院药物化学教研室,贵州遵义563099;中国科学院南海海洋所中国科学院热带海洋资源与生态重点实验室,广东广州510301
  • 2. 中国科学院南海海洋所中国科学院热带海洋资源与生态重点实验室,广东广州510301
  • 3. 遵义医科大学药学院药物化学教研室,贵州遵义563099
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摘要

目的 从一株深海放线菌S.koyangensis SCSIO 5802中分析鉴定多烯大环内酯类抗生素candicidin的生物合成基因簇,并推导其生物合成途径.方法 ①利用PCR-targeting方法对负责abyssomicin类化合物的聚酮合酶abmB1进行同框缺失,并利用HPLC-MS对获得的突变株SCSIO 5802A代谢产物进行分析以鉴定其它新型化合物;②利用生物信息学方法对S.koyangensis SCSIO 5802的全基因组序列进行注释分析,以寻找candicidin的生物合成基因簇;③结合candici-din结构特征、基因簇内生物合成基因的功能以及Ⅰ型聚酮化合物的生物合成原理,对其生物合成途径进行推导;④利用阿普拉抗性基因片段对candicidin生物合成基因簇中的聚酮合酶基因canD进行替换突变,以确定基因簇的正确性.结果 abmBl基因的同框缺失突变株SCSIO 5802A不生产abyssomicins类化合物,从该突变株中鉴定了一类之前未发现的多烯大环内酯类化合物candicidins;利用生物信息学鉴定了candicidin生物合成基因簇,并对其生物合成途径进行了推导;对聚酮合酶基因canD进行抗性替换突变获得的突变株SCSI0 5802AC不生产candicidins类化合物,确认了该基因簇的正确性.结论 本研究将为利用组合生物合成的方法获得candicidin新结构衍生物以及基于基因组信息的新型天然产物挖掘奠定了基础.

关键词

S.koyangensis/SCSIO/5802/多烯大环内酯/生物合成/基因簇

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基金项目

国家自然科学基金资助项目(NO:31670087)

国家自然科学基金资助项目(21462057)

出版年

2019
遵义医学院学报
遵义医学院

遵义医学院学报

CSTPCD
影响因子：0.692
ISSN：1000-2715
被引量1
参考文献量2
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