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江苏盐城沿海滩涂湿地放线菌多样性及功能基因的筛选

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目的 研究江苏盐城沿海滩涂湿地中可培养放线菌的多样性,并比较不同分离培养基对该批样品放线菌的分离效果以及进行NRPS、PKS I、PKS Ⅱ功能基因筛选.方法 使用6种分离培养基,对采集的4份土壤样品中的放线菌进行选择性分离.通过16S rRNA基因序列分析所分离得到的放线菌多样性.运用PCR技术检测菌株合成相关基因的情况.结果 菌株去重复后,分离得到放线菌共134株,主要分布于放线菌域的4个目7个科12个属中,除优势菌链霉菌属(Streptomyces)外,还分离到微杆菌属(Microbacterium)、节杆菌属(Arthrobacter)、Paenarthrobacter等稀有放线菌属;菌株BY5-10与最近有效发表菌株Agromyces binzhouensis Oact353T(GenBank登录号:KC493987)的16S rRNA基因序列相似率为98.35%,可能为放线菌科壤霉菌属的潜在新种;菌株EY6-7与最近有效发表菌株Mycetocola manganoxydans MB1-14T(GenBank登录号:GU217690)的16S rRNA基因序列相似率为99.14%,可能为诺卡氏菌科Mycetocola的潜在新种;53株菌存在至少1种所探测的生物合成基因簇,阳性率为87.3%.结论 江苏盐城沿海滩涂湿地中有着多样性丰富的放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种及新抗生素的潜力.
Diversity and biosynthetic gene of culturable Actinobacteria isolated from beach in Yancheng of Jiangsu province

郑洁、庹利、李伟、保玉心

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遵义医科大学研究生院,贵州遵义563099

遵义医科大学医学与生物学研究中心遵义市理化分析测试工程研究中心,贵州遵义563099

滩涂 放线菌 多样性 功能基因

国家自然科学基金资助项目国家自然科学基金资助项目

NO:3146000681603079

2019

遵义医学院学报
遵义医学院

遵义医学院学报

CSTPCD
影响因子:0.692
ISSN:1000-2715
年,卷(期):2019.42(3)
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