查看更多>>摘要:[目的]通过解析保罗蓝睡莲花转录组数据的SSR位点特征信息,开发新的与表型相关的SSR标记,为睡莲种质资源评价、新品种选育提供科学依据.[方法]以热带睡莲保罗蓝不同花器官部位(雌蕊、雄蕊、花瓣)的转录组数据为背景材料,用MISA软件检索序列的SSR位点,采用Excel对位点特征进行分析作图,Primer 3.0软件设计引物,TP-M13-SSR PCR筛选引物.[结果]在花器官转录组的 39079条Unigenes中共检测到 12365个SSR位点,位点发生频率为 31.64%,平均每 5.79 kb出现 1个SSR位点.SSR位点的重复类型主要为二核苷酸重复碱基,占 SSR位点总数的 71.85%,优势重复类型为 AG/CT,占碱基总数的 61.34%;其次为三核苷酸重复碱基,为26.10%,优势重复类型是AAG/CTT,占比 8.30%.SSR碱基重复次数在 5~20次,序列长度为 12~30 bp,平均长度18.38 bp.引物设计获得 9212对引物,从中随机挑选 100对进行PCR扩增验证,筛选出 9对多态性好的引物,可将12份睡莲种质在遗传相似系数为 0.735时聚为 3支.[结论]热带睡莲保罗蓝花器官转录组中的SSR位点分布频率高、类型丰富,多态性较高,具较大的应用潜力.开发的 9对SSR引物可将 12份种质有效分开,进一步丰富了睡莲现有SSR标记,可为睡莲属植物的遗传多样性分析和分子辅助育种提供科学参考.