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生物工程学报
生物工程学报

杨胜利

月刊

1000-3061

cjb@im.ac.cn

010-64807509

100101

北京朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401

生物工程学报/Journal Chinese Journal of BiotechnologyCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>《生物工程学报》是国内外公开发行的全国性学术期刊, 由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会共同主办。主要报道生物工程研究的新发展、新成果、新技术。刊登的内容包括：基因工程、细胞工程、酶工程、生化工程、组织工程、生物信息、生物制药、生物芯片等。栏目设有：综述、研究报告、研究简报、技术与方法等。《生物工程学报》创刊于1985年。20多年来，本刊始终以推动生命技术发展和促进国家经济建设为宗旨，及时报道我国生物工程方面的重要研究成果, 有力地促进了国内在这一领域的学术交流，为科研教学和经济建设发挥了积极的作用。本刊已被美国<CA>,<BA>，<MEDLINE>,及<俄罗斯文摘>、中国生物学文摘、中国科学引文数据库、万方数据库、中国科技期刊光盘版等检索系统收录，是中国自然科学核心期刊。
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    乙型肝炎病毒上调的lnc-HUR1抑制肝癌细胞凋亡

    陈永臣温金燕祁丹丹童晓梅...
    3501-3514页
    查看更多>>摘要：Lnc-HURl是乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)上调的长链非编码RNA,具有促进肝癌细胞增殖和促进肝癌发生发展的功能.为探究lnc-HUR1对肝癌细胞凋亡的影响,通过免疫印迹、实时荧光定量PCR、双荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、流式细胞术等实验方法,检测lnc-HUR1对肝癌细胞凋亡的影响.转化生长因子-β(tansforming growth factor-β,TGF-β)、五氟尿嘧啶和星孢菌素诱导肝癌细胞凋亡的实验结果显示,过表达lnc-HUR1能够显著降低caspase3/7的活性以及PARP-1的剪切,而敲低lnc-HUR1则能够显著增加caspase3/7的活性,促进PARP-1的剪切;Annexin-V和PI联合染色实验也表明过表达lnc-HUR1能够抑制细胞凋亡,敲低lnc-HUR1能够促进细胞的凋亡.同时过表达lnc-HUR1能够在RNA水平和蛋白水平上调凋亡抑制因子Bcl-2(B cell lymphoma-2)、下调促凋亡因子BAX(B cell lymphoma-2-associated x),从而抑制细胞的凋亡.在CCL4诱导的小鼠急性肝损伤模型中,lnc-HUR1转基因小鼠肝组织中Bcl-2的表达高于对照小鼠.染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)实验也证实lnc-HUR1能够降低p53在Bcl-2和BAX启动子区的富集.以上结果说明,lnc-HUR1通过促进凋亡抑制因子Bcl-2及抑制凋亡促进因子BAX的表达抑制肝癌细胞的凋亡.进一步的实验表明,在HCT116细胞中lnc-HUR1能够调控Bcl-2和BAX的转录,而在HCT116 p53-/-细胞中,lnc-HUR1对Bcl-2和BAX的表达没有影响,说明lnc-HUR1对肝癌细胞凋亡的抑制作用依赖于p53的活性.综上所述,HBV上调的lnc-HUR1具有抑制肝癌细胞凋亡的作用,lnc-HUR1通过抑制p53转录活性,上调凋亡抑制因子Bcl-2、抑制凋亡促进因子BAX的转录,从而抑制细胞凋亡.上述结果提示Lnc-HUR1在HBV相关肝癌发生发展中发挥重要作用.

    乙型肝炎病毒肝癌长链非编码RNAlnc-HUR1凋亡

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    基质金属蛋白酶-2/9敏感型可跨膜融合抗氧化酶的表达、纯化和表征

    何火聪林丽香李玲玲吴伦巧...
    3515-3527页
    查看更多>>摘要：融合了跨膜肽的抗氧化酶可进入细胞,保护细胞免受放射损伤.然而跨膜肽的跨膜能力没有靶向性,其也可把抗氧化酶带入肿瘤细胞进而保护肿瘤细胞,降低放疗的效果.为此,根据多数肿瘤细胞微环境中存在活性基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)-2或MMP-9的特点,在细胞跨膜肽R9与人铜、锌超氧化物歧化酶(superoxide dismutase 1,SOD1)和谷胱甘肽S-转移酶(glutathione S-transferase,GST)之间融合 MMP-2/9的底物肽X,设计了融合蛋白GST-SOD1-X-R9.该蛋白在肿瘤微环境中可因MMP-2/9酶切底物肽X而失去跨膜肽,从而无法进入肿瘤细胞,进而只能进入正常细胞.全基因合成SOD1-X-R9序列,并将其插入原核表达载体pGEX-4T-1中,得到表达质粒,并实现了GST-SOD1-X-R9融合蛋白的可溶表达.GST-SOD1-X-R9经硫酸铵沉淀和GST亲和层析纯化,分子量约为47kDa,与理论值一致.纯化的融合蛋白的SOD活性和GST活性分别为2 954 U/mg和328 U/mgoGST-SOD1-X-R9的SOD活性或GST活性在生理条件下几乎没有变化.该融合蛋白在溶液中可被胶原酶Ⅳ部分水解.分别建立了2D和3D培养的HepG2细胞模型来检验肿瘤微环境中的MMP-2活力对该蛋白跨膜能力的影响.在2D培养模型中,HepG2的MMP-2活力极低,但在3D培养模型中,随着培养时间的增加,HepG2肿瘤球的体积变大,其胞外MMP-2活力也随之增强.GST-SOD1-X-R9在2D培养的HepG2细胞中具有和GST-SOD1-R9蛋白一样的跨膜效率,但在3D培养的HepG2细胞球中的跨膜能力大大降低.本研究为后续深入研究GST-SOD1-X-R9靶向防护正常细胞的氧化损伤效应奠定了基础.

    抗氧化酶MMP-2/9敏感性可跨膜大肠杆菌表达体系纯化稳定性

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    条纹斑竹鲨肝脏环形RNA的筛选、鉴定及功能分析

    覃萍张文杰吕正兵
    3528-3541页
    查看更多>>摘要：为筛选和验证条纹斑竹鲨肝脏中环形RNA(circRNA)及探究其在肝癌细胞HepG2中过表达对肝癌细胞增殖、迁移能力的影响,本研究主要进行了两项实验:对条纹斑竹鲨肝脏circRNA进行高通量测序和预测,随后设计正、反向引物验证其真实性;构建circRNA过表达载体,将其瞬时转染进肝癌细胞HepG2,进行CCK-8和划痕实验来评价其对肝癌细胞增殖和迁移能力的影响.结果显示:预测到有4 558条circRNAs,并确认了14条circRNAs的真实性;qRT-PCR实验表明在肝癌细胞 HepG2 中能瞬时过表达 circRNA 13-566、circRNA 4-475、circRNA 5-402、circRNA 294-177、circRNA 30-219;且CCK-8和划痕实验显示,这5条circRNAs过表达后,均能不同程度地抑制肝癌细胞的增殖和迁移能力,其中circRNA 4-475、circRNA 294-177作用尤为显著.上述结果为深入研究条纹斑竹鲨肝脏中circRNA及其在肝再生、肝癌治疗方面的功能提供了新思路和基础.

    条纹斑竹鲨circRNA鉴定HepG2功能

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    不同粪便DNA提取方法比较分析

    史志远陈璐萍李博星朱宝利...
    3542-3550页
    查看更多>>摘要：肠道微生物群落结构和多样性与人体疾病密切相关.然而,相关群落结构分析结果可能受到DNA提取质量等实验因素影响.因此,评估不同DNA提取方法对肠道特定种属的提取效果,对于全面、准确获取人体肠道微生物谱,深入探究肠道微生物群落结构具有指导意义.本研究旨在借助实时荧光定量 PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT qPCR)技术,以 DNA提取纯度、浓度,以及对肠道中特定种属微生物基因组DNA的提取丰度为指标,对5种DNA提取方法进行比较分析.结果表明,试剂盒Q的提取效果最佳,特别是对乳杆菌属和双歧杆菌属等革兰氏阳性菌的提取效果较好.N试剂盒的平均DNA提取浓度较Q试剂盒低,但在纯度方面,二者无显著性差异.与其他3种商用试剂盒(M、PSP、TG)相比,N方法对肠道内指定微生物基因组的提取效果仅次于Q试剂盒,位居第二.相比之下,M试剂盒提取所得DNA,质量较高,但浓度偏低,对于肠道内革兰氏阳性菌的提取效果不很理想.TG试剂盒和PSP试剂盒提取所得DNA在浓度、质量以及细菌丰度方面均不及其他验证的试剂盒.综上,Q试剂盒可作为肠道微生态研究相关实验中获取高质量基因组DNA的提取方法.本研究结果为肠道微生态研究相关实验中基因组DNA提取方法的选择提供参考依据.

    基因组DNA肠道微生物粪便定量PCR

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    EGFRvⅢ胞外区基因重组腺病毒的构建及单域抗体的制备

    张慧敏徐嘉奇程艺付山...
    3551-3562页
    查看更多>>摘要：本研究旨在构建能够表达人表皮生长因子EGFRvⅢ 胞外区基因的重组腺病毒,并通过免疫骆驼构建噬菌体单域抗体库,筛选和制备EGFRvⅢ胞外区特异性单域抗体并对其进行鉴定.从人前列腺癌细胞系PC-3细胞中提取总RNA,反转录为cDNA,以cDNA为模板扩增EGFRvⅢ胞外区基因,并连接pAdTrack-CMV质粒载体,转化含有pAdEasy-1的大肠杆菌(Escherichia coli)BJ5183感受态细胞,获得同源重组质粒转染HEK293A细胞,得到表达EGFRvⅢ胞外区蛋白的重组腺病毒.利用重组腺病毒免疫双峰驼,构建EGFRvⅢ胞外区特异性噬菌体单域抗体库,并以EGFRvⅢ蛋白为筛选抗原,对其进行筛选,对筛选得到的单域抗体进行诱导表达、纯化及鉴定.结果表明获得了表达EGFRvⅢ 胞外区基因的重组腺病毒.构建得到的EGFRvⅢ特异性噬菌体单域抗体库的库容为1.4×109;经过3轮富集和筛选,通过噬菌体ELISA筛选出31个与EGFRvⅢ胞外区蛋白结合的阳性克隆,并对OD450值较高的重组单域抗体E14进行了表达和纯化.经ELISA鉴定,重组单域抗体E14可与EGFRvⅢ胞外区蛋白产生抗原抗体结合反应,具有较高的亲和力.说明制备的EGFRvⅢ特异性噬菌体单域抗体库具有较高的库容和多样性,且筛选得到的单域抗体具有较高的抗原活性和免疫学反应性,为今后以EGFRvⅢ为靶点的恶性肿瘤的诊断和治疗提供新的实验依据.

    EGFRvⅢEGFRvⅢ胞外区蛋白重组腺病毒单域抗体抗体库

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    《生物工程学报》征稿简则

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