查看更多>>摘要:目的 通过平行反应监测(parallel reaction monitoring,PRM)定量蛋白组学技术验证晚期肺腺癌患者表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)-T790M耐药突变的生物标志物.方法 纳入2018年1月至2018年12月就诊于新疆医科大学附属肿瘤医院的口服EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitor,TKI)吉非替尼的具有EGFR 19del或EGFR 21 L858R基因突变的晚期肺腺癌患者44例.在患者疾病进展后行组织活检,使用下一代测序(next generation sequencing,NGS)方法检测出EGFR-T790M突变患者24例,非EGFR-T790M突变20例.提取44例患者的血清蛋白,通过SDS-PADE进行质量评估,两组分别得到10例质量合格血清蛋白样本.质量合格的血清蛋白样品分别进行丝氨酸蛋白酶酶解,通过 PRM 方法进行纳米液相色谱-串联质谱分析法(nanometer liquid chromatography-tandem mass spectrometry,nanoLC-MS/MS)检测.运行Skyline软件进行数据分析,得出与EGFR-T790M突变相关的差异表达蛋白.将基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库的各节点映射,进行功能富集分析,并利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库提供的绘图模块进行差异表达蛋白表达含量渲染,采用STRING数据库构建差异表达蛋白的蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,寻找关键差异表达蛋白.结果 通过PRM方法确定14种与晚期肺腺癌EGFR-T790M突变相关的差异表达蛋白.GO富集分析显示,这些差异表达蛋白在参与细胞组分方面,主要构成细胞外区域的部分;在发挥的分子功能方面,主要为抗原结合、作用于L氨基酸肽的肽酶活性和免疫球蛋白受体结合.KEGG富集通路分析显示,补体和凝血级联反应差异表达蛋白富集指数最高.该通路上的差异蛋白为凝血因子X(coagulation factor X,F10)、F9、纤溶酶原(plasminogen,PLG)和羧肽酶B2(carboxypeptidase B2,CPB2).其中F10为上调蛋白,其余为下调蛋白.PPI网络构建分析显示,CBP2为差异表达蛋白中的关键节点.结论 CBP2是晚期肺腺癌EGFR-T790M耐药突变发生的潜在生物标志物.