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中国病毒病杂志
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中国病毒病杂志/CSTPCD
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    2023年11月全国法定传染病疫情概况

    国家疾病预防控制局
    47页
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    2016-2021年云南省手足口病CVA9型肠道病毒VP1区基因分子进化特征分析

    姜黎黎乔恩发杨溪寸建萍...
    48-53页
    查看更多>>摘要：目的 探讨2016-2021年云南省手足口病CVA9型肠道病毒VP1区基因分子进化特征,为手足口病的预防和控制提供科学依据.方法 对云南省2016-2021年各州市采集的手足口病核酸检测阳性的病例标本进行病原分型分析,通过细胞培养,富集病毒后进行VP1区基因测序,采用DNA/Star软件进行核苷酸及氨基酸序列比对和基因进化特征分析.用Mega 5.2软件邻位相接法和Kimura 2参数法构建CVA9的基因进化树.结果 云南省共分离到6株CVA9病毒株;CVA9毒株分布在4个州市,阳性病例均表现为轻症,年龄分布在7岁及以下年龄段,发病时间段主要集中在1-2月份.其中VP1区基因在11、12、18、84、132等位点氨基酸变化活跃.CVA9的10个基因组(A～J)之间的核苷酸差异率均大于15％,云南省分离的6株CVA9毒株分布在B基因组的G亚型.各CVA9株之间核苷酸、氨基酸差异率分别为15.75％～24.72％、1.39％～2.16％.云南省分离的6株CVA9毒株和国内云南、山东、浙江参考株遗传距离较近.结论 2016-2021年引起手足口病的CVA9病毒散在流行,与国内部分省市引起手足口病的毒株共进化、共循环.

    手足口病人类肠道病毒CVA9VP1区基因序列分析

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    2023年12月全国法定传染病疫情概况

    国家疾病预防控制局
    53页
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    云南省1株分离自手足口病病例的新型肠道病毒EV-A89的分子生物学鉴定

    寸建萍田炳均姜黎黎周晓芳...
    54-58页
    查看更多>>摘要：目的 对云南省1株从手足口病病例中分离得到的新型肠道病毒EV-A89进行分子生物学鉴定,并对其基因特征进行分析.方法 对2022年1-12月云南省手足口病实验室监测网络收集的1448份手足口病病例粪便标本进行病毒分离,将经处理的便悬液接种于人横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞和人喉表皮样癌(human epidermoid carcinoma,Hep-2)细胞,在出现典型的细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)后,采用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对阳性分离物进行VP4/VP2结合区序列和VP1区基因扩增,对扩增产物进行基因测序(Sanger法).用Sequencher 5.4.5软件对测序图谱进行拼接和编辑,分别得到病毒VP4/VP2结合区序列和VP1区序列.对病毒株VP4/VP2结合区序列和VP1区序列进行序列鉴定,得到1株EV-A89(标本编号:B36).用Mega5.2软件的邻位相接法(neighbor jorning method)和Kimura 2参数法(Kimura 2 parameter)构建B36株病毒的基因进化树.结果 1448份手足口病病例粪便标本中,共分离得到126株病毒.对病毒株VP4/VP2结合区和VP1区序列鉴定,得到1株EV-A89.VP4/VP2结合区的序列同源性分析表明,该病毒最接近分离自新疆的1株EV-A89病毒(KSYPH-TRMH22F-XJ-CHN-2011,KT277550,以下简称 KSYPH-TRMH22F),二者的核苷酸(nucleotide,nt)相似性为100.00％,氨基酸(amino acid,aa)同源性为100.00％;该病毒与EV-A89原型株BAN00-10359-BAN-2000(基因库编号:AY697459)的核苷酸相似性为93.82％,氨基酸同源性为99.38％;在VP1区,该病毒也最接近分离自新疆的EV-A89病毒KSYPH-TRMH22F;该病毒与KSYPH-TRMH22F的核苷酸相似性为99.66％,氨基酸同源性为98.99％;该病毒与EV-A89原型株BAN00-10359的核苷酸相似性为97.90％,氨基酸同源性为98.31％.结论 在云南省2022年手足口病病例中检测到1株EV-A89病毒,该病毒为肠道病毒A组的一种新型病毒.

    手足口病新型肠道病毒EV-A89基因特征分析

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    云南省2022年手足口病病例中2株埃可病毒11型VP1区基因特征分析

    罗春蕊徐敏姜黎黎寸建萍...
    59-65页
    查看更多>>摘要：目的 对云南省2022年从手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中分离到的2株埃可病毒11型(echovirus 11,E11)进行分子生物学鉴定并对它们的VP1区基因特征进行分析.方法 对2022年云南省手足口病实验室监测网络收集到的手足口病病例粪便标本进行病毒分离,对阳性标本先进行VP4/VP2结合区逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)和基因测序定型,再对VP4/VP2结合区初步定型的标本进行VP1区RT-PCR和测序,用MEGA 7.0软件构建病毒VP1区基因进化树,进行基因特征分析.结果 2022年从云南省手足口病病例粪便标本中检测到2株E11病毒,VP1区基因序列同源性分析结果表明,2株病毒最接近3株在欧洲葡萄膜炎(uveitis)病例中分离的病毒.本研究分离的2株病毒与欧洲3株病毒之间核苷酸相似性(nucleotide,nt)和氨基酸(amino acid,aa)同源性分别为84.37％(差异率15.63％)和95.21％(差异率4.79％).云南2株和E11原始株(Silva)之间的核苷酸相似性为80.03％(差异率为19.97％),氨基酸同源性为93.50％(差异率6.50％),与原型株(Gregory)的核苷酸相似性为76.95％(差异率23.05％),氨基酸同源性为88.02％(差异率11.98％).本次云南分离的2株E11为D5亚型.结论 2022年云南省手足口病实验室检测到的2株E11为D5亚型,是目前云南和整个中国最为流行的基因亚型.应进一步加强对非脊灰肠道病毒(non-polio enteroviruses,NPEVs)和非EV-A71、非CVA16等手足口病中"其他肠道病毒"(other enteroviruses)尤其是E11病毒的分子生物学检测.

    手足口病肠道病毒埃可病毒11型基因特征分析

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    甲醛灭活工艺对By型流感病毒的灭活效果及其抗原稳定性的影响

    郭习勤魏蕾张伟安文珏...
    66-70页
    查看更多>>摘要：目的 评价终浓度为100 μg/ml甲醛、2～8℃、10d灭活工艺对2022年四价流感病毒裂解疫苗生产用By(B/Phuket/3073/2013/BVR-1B)病毒毒株灭活的适用性.方法 病毒收获液(鸡胚病毒培养产物)经过澄清过滤,控制蛋白浓度＜800 µg/ml,温度2～8℃,添加甲醛溶液至终浓度100 µg/ml,对病毒收获液进行灭活.在灭活第0、1、2、3、4、5、10天取样,采用鸡胚半数感染剂量(median infective dose,EID50)法检测病毒滴度,采用Reed-Muench法计算lgEID50/ml;采用直接血凝法检测流感病毒血凝滴度;对灭活10d的样品进行病毒灭活验证试验;灭活10d后的病毒液经超滤、离心、层析等工艺提纯,取样进行透射电镜观察病毒颗粒完整性.结果 病毒收获液灭活第0、1、2、3、4、5、10天的病毒滴度分别为(8.5±0.4)、(4.2±0.5)、(1.3±0.4)、0、0、0、0 lgEID50/ml,血凝滴度结果均在 1∶256～1∶512;病毒灭活验证试验显示,经过10d的灭活,病毒均已全部灭活;透射电镜观察显示,所得的病毒均为完整病毒颗粒.结论 终浓度100 µg/ml甲醛、2～8℃灭活10 d的灭活工艺可用于By(B/Phuket/3073/2013/BVR-1B)流感病毒的灭活处理.

    流感病毒病毒滴度灭活血凝滴度病毒灭活验证

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    2022年昆明市407例手足口病病例病原学监测分析

    李丽张倩马绍辉张磊...
    71-76页
    查看更多>>摘要：目的 了解2022年云南省昆明市手足口病病例的病原构成,为手足口病的预防和控制提供科学依据.方法 收集2022年6-9月昆明市儿童医院诊断为手足口病患儿的407份粪便样品,采用巢式反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)方法对粪便样品进行肠道病毒核酸检测,利用通用肠道病毒引物扩增其VP1区基因并测序,采用SPSS 11.5,肠道病毒定型和Mega 6.0等软件分析数据.结果 407份粪便样品中,肠道病毒阳性检出率为74.69％(304/407),有13种肠道病毒被检测到,其中,柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)所占比例最高,达42.43％(129/304),其次是 CVA16(35.53％,108/304)、CVA5(11.84％,36/304)、CVA12(2.30％,7/304)、CVA2(1.97％,6/304)、CVA10(1.31％,4/304),CVA4、柯萨奇病毒 B组 5型(coxsackievirus B5,CVB5)和埃可病毒 11 型(echovirus 11,E11)均各占 0.99％(3/304),CVB2 占 0.66％(2/304),CVA8、E3和肠道病毒A组71型(enterovirusA71,EV-A71)均各占0.33％(1/304).其中CVA6和CVA16分别属于B1a和D3a基因型.结论 2022年昆明市儿童医院手足口病由13种肠道病毒引起,其中CVA6和CVA16为优势病原体并属于中国流行株.

    手足口病病原学肠道病毒柯萨奇病毒A组6型柯萨奇病毒A组16型系统发育

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    2019-2022年贵州省疾病预防控制中心犬伤门诊狂犬病暴露人群流行病学特征分析

    慕欣吴安忠贺金李亚情...
    77-81页
    查看更多>>摘要：目的 了解2019-2022年贵州省疾病预防控制中心犬伤门诊狂犬病暴露人群流行病学特征,为优化卫生医疗资源配置、制定科学预防控制措施提供参考依据.方法 收集贵州省疾病预防控制中心犬伤门诊2019-2022年狂犬病暴露人群接诊信息,采用描述性流行病学方法,对暴露就诊人群特征、暴露分级、伤人动物、伤口处置、疫苗接种等指标进行分析.结果 2019-2022年贵州省疾病预防控制中心犬伤门诊狂犬病暴露就诊人数为24 116例,7-8月份为就诊高峰期.暴露人群男女性别比为1∶1.18,14岁以上年龄者居多,其他职业(非农民、学生、散居儿童)人群占比最高,为65.43％(15 780/24 116).伤人动物主要为猫致伤,暴露程度Ⅲ级比例最高,占总暴露数的54.46％(13 134/24 116).暴露就诊人群中暴露伤口自行处理者占90.57％(21 841/24 116);去医院处理占9.41％(2 270/24 116);未处理的占0.02％(5/24 116).就诊人群中暴露至接种时间在24 h内的占85.80％(20 692/24 116);在1～3 d占10.50％(2 531/24 116);在3d以上占3.70％(893/24 116).暴露就诊人群均全部接种狂犬病疫苗,但联合使用狂犬病被动免疫制剂注射人数为2098例,占应注射人数的15.97％(2 098/13 134).结论 贵州省疾病预防控制中心犬伤门诊接诊的狂犬病暴露人群以14岁以上的人群为主,主要为猫致伤,具有伤口处理和暴露接种意识的人群占比高.应强化狂犬病健康教育,提升规范化狂犬病门诊建设质量,制定规范的、有针对性的暴露前后处置策略,从而降低狂犬病发病率.

    狂犬病流行病学人群监测犬伤门诊

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    全国传染病应急临床试验工作方案

    国家卫生健康委科技部国家医保局国家药监局...
    81,87,100页
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    深圳市126例男男同性性行为者8种疱疹病毒感染的初步研究

    叶薇胡鹏威昌华平杨梓杰...
    82-87页
    查看更多>>摘要：目的 了解深圳市男男同性性行为人群(men who have sex with men,MSM)八种疱疹病毒(her pes viruses,HHV)携带率,分析深圳市MSM人群HHV感染的危险因素.方法 采用非概率抽样法收集2021年4月—12月在深圳市咨询检测的男性口腔拭子及调查问卷,分为MSM组及对照组,用实时荧光定量核酸扩增技术,对8种HHV DNA进行检测,用Epidata双份录入问卷.对调查对象的人口学信息进行描述性分析,采用x2检验分析其性行为情况和HIV、梅毒、疱疹病毒感染情况,采用logistic回归进行HIV、疱疹病毒感染危险因素分析.结果 共调查250人,其中MSM组126人,对照组124人.MSM组HHV人群中,HSV-1携带率为9.52％(12/126)、HSV-2携带率为2.38％(3/126)、VZV携带率为0、EBV携带率为 37.30％(47/126)、HCMV携带率为 0.79％(1/126)、HHV-6携带率为 19.05％(24/126)、HHV-7携带率为94.44％(119/126)、HHV-8携带率为0.79％(1/126);对照组人群HSV-1携带率为2.42％(3/124)、HSV-2 携带率为 4.03％(5/124)、VZV 携带率为 0、EB 病毒携带率为 20.16％(25/124)、HCMV携带率为 0、HHV-6携带率为 14.52％(18/124)、HHV-7携带率为 95.57％(119/124)、HHV-8携带率为0.MSM组的HSV-1、EB病毒携带率显著高于对照组(x2分别为5.593、8.954;P均＜0.05);灌肠行为(aOR=6.549,95％CI:1.773～24.184)是 HSV-1 感染的危险因素,吸烟(aOR=3.277,95％CI:1.219～8.807)是EB病毒感染的危险因素;未发现其他HHV感染相关危险因素.结论 减少灌肠行为有助于减少HSV-1感染的发生,减少吸烟有助于减少EBV感染的发生.由于MSM人群具有较高的HIV感染风险,会引发较重的HHV疾病负担,虽然MSM组与对照组的6种HHV感染谱总体相近,但有必要加强MSM人群HHV感染的监测和干预.

    男男同性性行为疱疹病毒核酸实时荧光定量核酸扩增技术人类免疫缺陷病毒

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