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期刊信息/Journal information
南方农业学报
广西壮族自治区农业科学院
南方农业学报

广西壮族自治区农业科学院

李杨瑞

月刊

2095-1191

nfnyxb@163.com

0771-3243905、3244920

530007

广西南宁市大学东路174号

南方农业学报/Journal Journal of Southern AgricultureCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是由广西农业科学院主办的综合性农业科技期刊，主要报道农业科研新成果、新技术、新方法，农业生产新经验、新产业等。
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    古樟树根腐病病原分离鉴定及室内防治药剂筛选

    杨玉婷龙仪珂张紫嫣熊家辉...
    3311-3323页
    查看更多>>摘要：[目的]分离并鉴定粤北地区古樟树根腐病的病原菌，筛选出适宜的防治药剂，为樟树根腐病的识别和诊断以及病害防治提供理论依据。[方法]采用组织块分离法对采集自粤北地区的古樟树根部病部组织进行病原菌分离，依据柯赫氏法则确定致病菌，通过形态学和分子生物学相结合的方法鉴定病原菌种类，进一步采用菌丝生长速率法测定不同杀菌剂对病原菌的室内抑制效果。[结果]从古樟树根部病部组织中共分离出3株真菌，分别标记为SG0122-1、SG0122-2和SG0122-3，通过柯赫氏法则验证，确定菌株SG0122-1和SG0122-3是引起古樟树根腐病的病原菌;结合形态学观察和系统发育进化树分析，将菌株SG0122-1和SG0122-3分别鉴定为无量山射脉革菌(Phlebia wuliang-shanensis)和少脉灵芝(Ganoderma subamboinense)。药剂筛选结果表明，不同供试杀菌剂对菌株SG0122-1和SG0122-3的菌丝生长抑制效果存在一定差异，其中氯氟醚·吡唑酯BAS 751 04F对菌株SG0122-1的抑制效果最强，在最低供试浓度下(3。91 μg/mL)能完全抑制其菌丝生长;其次是98%溴菌腈和96。8%苯醚甲环唑，抑制中浓度(EC50)分别为7。48和10。63 μg/mL;98%嘧菌酯和96。8%苯醚甲环唑对菌株SG0122-3菌丝生长有较好的抑制作用，其EC50分别为2。13和3。11 μg/mL，其次是97%吡唑醚菌酯和98%福美双，EC50分别为58。83和59。72 μg/mL。[结论]粤北地区古樟树根腐病病原为无量山射脉革菌和少脉灵芝。氯氟醚·吡唑酯BAS 751 04F、98%溴菌腈和96。8%苯醚甲环唑为防治无量山射脉革菌的有效药剂，98%嘧菌酯和96。8%苯醚甲环唑为防治少脉灵芝的有效药剂，其中96。8%苯醚甲环唑对2株病原菌均具有较好的抑制效果，以上药剂均可作为生产上防治樟树根腐病的候选药剂。

    樟树根腐病病原菌药剂筛选

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    两种入侵植物在海南省的分布格局与风险分析

    李晓霞曾力旺曾安逸董定超...
    3324-3332页
    查看更多>>摘要：[目的]预测巴西含羞草和无刺含羞草2种入侵植物在海南省的潜在地理分布，确定2种入侵植物在海南省的入侵风险等级，为海南省入侵植物管理和防治工作提供参考。[方法]利用MaxEnt模型和GIS地理信息系统评估制约巴西含羞草和无刺含羞草的主要环境变量，模拟并划分2种入侵植物在海南省的潜在入侵地理分布;开展2种入侵植物定性定量入侵风险分析，确定其危险级别。[结果]模拟结果显示，巴西含羞草和无刺含羞草受试者工作特征曲线面积(AUC)分别为0。956和0。996，结果远高于随机预测值0。500，表明模型预测结果具有较高的可信度。模型预测结果显示，2种入侵植物在我国的适生区主要分布在南方，尤其以广东、海南、福建等省份分布最为密集;其中，在海南省的潜在适宜区域主要集中在东北部，并有向西南扩散的趋势，与实际调查结果分布区域基本吻合。纬度分布预测结果发现，巴西含羞草主要分布在北纬50º～南纬50º，无刺含羞草则主要分布在北纬10º～30º。根据风险指标体系准则层赋值，计算得出巴西含羞草风险值(R)=69。15，高于61。00，为特别危害物种;无刺含羞草R=58。00，介于29。50～61。00，为高度危害物种。[结论]巴西含羞草为特别危害物种，应严格禁止引入;无刺含羞草属于高度危害，必须严格限制引入。由于2种入侵植物已经传入我国，应采取必要的应急措施，开展检疫、监测和灭除等工作，防止其进一步扩散和造成更大的危害。

    巴西含羞草无刺含羞草MaxEnt模型预测入侵风险分析海南省

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    文冠果LBD基因家族鉴定及其对盐胁迫的响应

    于涵杨磊姜涛刘博...
    3333-3345页
    查看更多>>摘要：[目的]对文冠果(Xanthoceras sorbifolium)侧生器官边界域(LBD)基因家族成员进行鉴定，并分析其在盐胁迫条件下的表达情况，为文冠果抗逆品种选育及其在盐碱地的推广利用提供理论依据。[方法]以文冠果全基因组数据为基础，从文冠果基因组数据库中鉴定获得LBD基因家族成员，通过ExPASy、MEME等生物信息学工具对XsLBD家族蛋白的理化性质、保守基序、顺式作用元件、基因结构和系统发育关系进行预测分析。对2个月苗龄的文冠果苗进行NaCl浓度为50、100、150 mmol/L盐胁迫处理，以NaCl浓度为0 mmol/L为对照组(CK)，对盐胁迫下文冠果根和叶组织中XsLBD家族基因的表达模式进行实时荧光定量PCR检测。[结果]从文冠果基因组中共鉴定到43个基因家族成员，命名为XsLBD1～XsLBD43。XsLBD家族蛋白编码138～404个氨基酸残基，理论等电点(pI)为4。60～9。75，分子量为15696。60～44476。88 kD，亚细胞定位结果显示，除XsLBD4、XsLBD8、XsLBD9、XsLBD20蛋白外，其余所有蛋白均定位于细胞核。有42个XsLBD家族基因分布在13条染色体上，XsLBD43基因则游离在染色体外。基于文冠果、拟南芥、水稻和毛果杨LBD氨基酸序列相似性构建系统发育树，结果显示，178个LBD家族蛋白可分为两大组(Class I和Class II)，其中Class I中包含38个XsLBD家族蛋白。XsLBD基因家族成员的外显子数目为1～5个，内含子数目为0～4个;所有XsLBD家族蛋白均含有Motif 2和Motif 3。XsLBD家族基因启动子中包含激素(水杨酸、脱落酸、生长素等)、应激(低温、干旱诱导等)及植物生长发育(种子特异性调控和昼夜节律控制等)响应元件。对文冠果苗进行不同浓度NaCl盐胁迫处理，结果显示，与CK相比，文冠果根、叶13个XsLBD家族基因中相对表达量存在显著差异(P<0。05，下同)的基因分别有12和11个，其中，XsLBD42基因在根和叶中相对表达量较CK高出约40倍。[结论]筛选获得43个XsLBD基因家族成员，其结构相对简单，具有一定保守性;XsLBD家族基因参与调控文冠果生长发育、新陈代谢和应激反应等过程;XsLBD9、XsLBD11、XsLBD23和XsLBD42等基因在文冠果盐胁迫响应中可能发挥重要作用。

    文冠果LBD基因家族表达分析盐胁迫

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    芽孢杆菌Ya-1的定殖特性及其对辣椒根际细菌多样性的影响

    赵志祥李道敏谭诗梦严婉荣...
    3346-3357页
    查看更多>>摘要：[目的]研究芽孢杆菌Ya-1(简称Ya-1)在辣椒根际、根和叶中的定殖特性及其对辣椒根际细菌多样性的影响，为微生态调控防治辣椒枯萎病及芽孢杆菌的开发利用提供参考依据。[方法]以自然土+蛭石(Ns)和灭菌土+蛭石(Ss)2组基质盆栽辣椒为试验材料，采用利福平标记法，分别对2组基质设接种无菌水(A)、接种抗200 μg/mL利福平的Ya-1突变株(Ya-1-200)发酵液(B)、接种辣椒枯萎病菌SMPLJLD-1孢子悬浮液(C)和接种Ya-1-200发酵液+辣椒枯萎病菌SMPLJLD-1孢子悬浮液(D)4个处理，接种后0、1、2、3、7、10和20 d，测定Ya-1在根际、根和叶片的定殖量的，并结合绝对定量PCR验证Ya-1的定殖规律。同时利用高通量测序技术对接种0、10、20 d根际细菌多样性及其群落结构差异进行比较分析。[结果]稀释分离法检测Ya-1在辣椒植株及根际中的定殖情况结果显示，接种3 d 后，B、D处理下根际和叶中Ya-1的定殖量逐渐下降，20 d后趋于稳定，定殖量均大于1×104 CFU/g。绝对定量PCR检测结果显示，B、D处理后，辣椒根际、根和叶中Ya-1单位样本拷贝数呈先增加后减少的变化趋势，接种3 d后达到峰值，并在20 d后稳定在1。0×105 copies/g以上。基于高通量测序分析结果显示，Ns组接种10 d与接种20 d相比，B处理ACE指数和Chao1指数显著降低(P<0。05，下同)，而C和D处理2个指数显著升高。辣椒根际细菌群落中相对丰度大于4%的优势菌门包括放线菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门和变形菌门。接种10 d时，C处理辣椒根际细菌群落中芽单胞菌门相对丰度最低(4。07%)，B处理该菌门的相对丰度最高(6。77%)。与A处理相比，B处理在接种10和20 d时贪铜菌属、Aquicella、Trinickia、Crenobacter、产碱杆菌属、戴氏菌属、假单胞菌属、Pseudogulbenkiania、芽孢杆菌属、罗河杆菌属和Vogesella均明显富集;接种10 d后，与A处理相比，B处理鞘氨醇单胞菌属的相对丰度明显升高，Gp6、假甲基杆菌属的相对丰度明显降低。[结论]Ya-1可在辣椒根际、根和叶中有效定殖，接种该菌后能改变辣椒根际细菌Alpha多样性指数，提高辣椒根际中具有抗病促生和改善辣椒品质等相关功能细菌的相对丰度。推测Ya-1具有开发应用的潜力。

    芽孢杆菌利福平标记绝对定量PCR定殖根际细菌多样性

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    不同基因型月季长宽法估算叶面积模型及有效性检验

    叶韵宇王俊云印轩鹏陈俊吉...
    3358-3368页
    查看更多>>摘要：[目的]研究不同基因型月季叶面积估算模型，并对其进行有效性检验，为月季叶面积测量和月季生长发育数字模型构建提供参考依据。[方法]以300个月季品种的6000片叶片为试验材料，采用游标卡尺测定每个品种月季叶片的叶长和叶宽，采用ImageJ图像处理软件获得测量叶面积，基于决定系数(R2)、均方根误差(RMSE)、归一化均方根误差(NRMSE)对建立的7个叶面积模型通过模拟叶面积分别与各品种的测量叶面积进行拟合，基于不同基因型月季的叶片品系、叶片形态的叶形系数3个因素对月季进行分类和模型系数的计算。[结果]7个叶面积估算模型中，模型3、4、7的模拟叶面积和测量叶面积分布于1∶1线附近，说明能较好地预测月季叶面积，其中模型4的R2为0。907，RMSE为0。726 cm2，NRMSE为0。082 cm2，精度较高且简便、通用性好，适用于大规模田间测量。不同月季品系间的模型系数无显著差异(P>0。05)。圆形叶片的平均模型系数显著高于卵圆形和椭圆形叶片(P<0。05，下同)。将叶片按叶形系数以0。2为1个间隔分为7类的分类下RMSE总值为0。863 cm2，小于利用叶形系数以0。4间隔分类(0。894 cm2)。随机选取70个月季品种对其叶面积模型进行验证，结果显示，叶形系数因子的叶面积模型系数的平均相对误差值为-0。499%，小于5%，表明基于叶形系数的叶面积模型系数可适用于测定月季叶面积。[结论]计算月季叶面积精度较高且通用性较好的模型公式为叶面积=平均模型系数×叶长×叶宽，叶形系数以0。2为1个间隔更能准确反映月季叶片的形状特征，利用平均模型系数计算的叶面积精度较高。

    月季叶面积模型长宽法不同基因型

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    断根胁迫下调控胡椒根系生长促进植株修复的生理机理

    祖超何倩郑维全李志刚...
    3369-3380页
    查看更多>>摘要：[目的]探明胡椒在不同程度断根处理和修复时间下根系自修复过程的生理机理，为胡椒及同类作物筛选适宜的机械耕作方法提供理论依据。[方法]以热引1号胡椒幼苗为研究对象，设不断根(对照，CK)、轻度断根、中度断根和重度断根4个处理，分别在断根后15、30和60 d测定分析幼苗根系内源激素含量、抗氧化酶活性、形态和活力指标、叶片光合速率和植株生长量，并对各指标间的关系进行结构方程模型分析。[结果]与CK相比，断根后30和60 d时，轻度断根和中度断根的植株鲜重增长量显著增加(P<0。05，下同)，且断根后60 d的叶片光合速率显著提高，轻度断根60 d的株高增长量显著增加。断根促进根系形态指标生长量显著增加，其中，中度断根30 d的根系平均直径增长量及60 d的根系总长度增长量、表面积增长量和平均直径增长量均显著高于CK。断根后60 d，轻度断根和中度断根的根系活力显著高于CK，分别较CK升高92。0%和66。6%，相对于重度断根有显著修复优势。断根处理对根系内源激素含量有明显调控作用，断根后15、30和60 d，重度断根均促进赤霉素(GA)含量显著升高，断根后15和30 d重度断根也促进细胞分裂素(CTK)含量显著升高。断根后15 d，中度断根和重度断根的超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性均显著高于CK;断根后30和60 d，3个断根处理的POD活性均显著高于CK。结构方程模型分析结果表明，断根通过影响根系内源激素含量、抗氧化酶活性和根系性状间接影响生物量性状，但不同修复时间下的影响指标和路径存在差异。[结论]胡椒断根后的生长修复是生长和生理指标相互作用的结果。前期根系内源激素促进根系生长，或通过正向调控抗氧化酶活性而间接促进根系生长启动修复;后期断根处理和内源激素负向调控抗氧化酶活性，促进根系生长完成修复。轻度断根和中度断根对胡椒生长修复有补偿或超补偿效应，重度断根时效性较低，60 d时才完成修复。

    胡椒断根内源激素抗氧化酶根系形态

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    质粒CRISPR/Cas9系统在马口鱼精原干细胞系基因编辑中的应用

    顾开妍徐海晶陶欣然吴璨...
    3381-3391页
    查看更多>>摘要：[目的]检测质粒CRISPR/Cas9系统在马口鱼精原干细胞(ObSSCs)和斑马鱼胚胎中的基因编辑效果，为开展基因编辑的SSCs移植提供技术支撑，进而推动养殖鱼类基因编辑育种工作的快速发展。[方法]将靶向红色荧光蛋白(RFP)的gRNA整合至可用于体内外基因编辑的整合质粒pCas9-zU6sgRNA(带有支架序列的向导RNA，由来自斑马鱼的U6启动子驱动)和报告质粒pCVpf-gRNA(向导RNA)中，然后分别转染ObSSCs和显微注射斑马鱼胚胎，通过荧光显微镜观察和PCR检测质粒CRISPR/Cas9系统在ObSSCs及斑马鱼胚胎中的基因编辑效果。[结果]以整合质粒pCas9-zU6sgRNA与报告质粒pCVpf-gRNA共转染正常ObSSCs及pCVpr质粒转染ObSSCs，在ObSSCs中能观察到绿色荧光，且在表达绿色荧光蛋白(GFP)的ObSSCs中观察到红色荧光信号明显减弱，而不转染质粒的ObSSCs未观察到绿色荧光信号;随着整合质粒pCas9-zU6sgRNA转染剂量由340 ng增加到410 ng，其基因编辑效率由0。10%增加到0。63%;此外，质粒CRISPR/Cas9系统在基因组中的编辑效率与在外源质粒中的编辑效率基本一致。为进一步检测质粒CRISPR/Cas9系统在体内的编辑效率，以整合质粒pCas9-zU6sgRNA与报告质粒pCVpf-gRNA共注射斑马鱼胚胎，24 h后能观察到绿色荧光信号，而空白对照组和阴性对照组斑马鱼胚胎均未观察到绿色荧光信号。对ObSSCs和斑马鱼的基因编辑效果进行PCR验证，发现试验组均能检测到修复的GFP片段，而空白对照组未检测到修复的GFP片段。此外，整合质粒pCas9-zU6sgRNA在斑马鱼胚胎中的基因编辑效率显著高于ObSSCs(100%vs 0。63%)(P<0。05)。[结论]由整合质粒pCas9-zU6sgRNA与报告质粒pCVpf-gRNA构成的质粒CRISPR/Cas9系统能在ObSSCs中直观评估基因编辑效率，且质粒CRISPR/Cas9系统在同为鲤科鱼类斑马鱼胚胎中的基因编辑效率高达100%。因此，质粒CRISPR/Cas9系统可用于马口鱼和斑马鱼的sgRNA筛选，为创制养殖鱼类新品种(系)提供新思路。

    马口鱼精原干细胞(SSCs)基因编辑质粒CRISPR/Cas9系统斑马鱼

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    基于全基因组重测序的拟鳄龟遗传多样性及遗传结构分析

    杨华琳李伟纪利芹朱新平...
    3392-3403页
    查看更多>>摘要：[目的]从全基因组水平开展拟鳄龟养殖群体遗传多样性及群体遗传结构分析，评估养殖拟鳄龟的种质资源状况，为拟鳄龟种质资源的开发与利用及促进其养殖产业健康发展提供参考依据。[方法]分别从肇庆高要市活道镇荣杰龟鳖专业合作社(RJ)、肇庆市滋源龟鳖养殖专业合作社(ZY)和肇庆市四会肇庆盛科农业发展有限公司(SK)各采集30只拟鳄龟，通过对3个拟鳄龟养殖群体90个样本进行基因组重测序，基于全基因组单核苷酸多态性(SNP)进行系统发育进化树分析和主成分分析，从基因组水平评估养殖拟鳄龟遗传多样性及群体遗传结构。[结果]基于形态性状比例参数的聚类分析结果显示，3个拟鳄龟养殖群体分为两大分支，SK群体与RJ群体先聚类在一起，然后与ZY群体聚合。在3个拟鳄龟养殖群体中共检测出708112个SNPs位点，过滤筛选后获得220950个高质量纯合SNPs位点和440435个高质量杂合SNPs位点。3个拟鳄龟养殖群体的单核苷酸密度均为0。01 SNP/kb，核苷酸多样性(π)为0。00166～0。00171，多态信息含量(PIC)为0。151～0。154，观测杂合度(Ho)为0。171～0。205，近交系数(FHOM)分布在0。0571～0。1110;不同群体间的遗传分化系数(Fst)在0。0056～0。0138，基因流(Nm)在-0。2486～-0。2466。基于全基因组SNP构建的系统发育进化树显示，3个拟鳄龟养殖群体整体上可分为两大分支，第一分支主要由RJ群体和SK群体组成，第二分支主要由ZY群体组成，与形态聚类分析结果基本一致。主成分分析也发现，3个拟鳄龟养殖群体间的相互距离较近，且存在相互交叉现象。[结论]3个拟鳄龟养殖群体遗传多态性较低，遗传背景不够丰富，群体间遗传分化程度低，推测具有相似的遗传背景，来源于同一引种群体。因此，在今后的育种工作亟需引入新的种质资源，为种质创新提供更丰富的遗传基础。

    拟鳄龟全基因组重测序遗传多样性遗传结构SNP位点

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    牦牛附睾不同区段上皮细胞SLC基因家族的表达分析

    吴逸韬潘美兰罗小凤潘城...
    3404-3413页
    查看更多>>摘要：[目的]揭示附睾不同区段溶质载体(SLC)蛋白的调控及功能差异，明确SLC基因家族在牦牛附睾中的表达情况，为提高牦牛繁育性能提供理论依据。[方法]从牦牛附睾头、附睾体和附睾尾的上皮细胞转录组数据中筛选出54个SLC基因家族差异表达基因(DEGs)，通过关联网络分析筛选出关键基因，然后采用实时荧光定量PCR检测DEGs在牦牛附睾不同区段上皮细胞中的表达情况。[结果]在牦牛附睾头vs附睾体中有SLC2A9、SLC8A1和SLC29A1等18个DEGs呈上调表达，SLC41A2、SLC40A1和SLC26A3等24个DEGs呈下调表达;在附睾头vs附睾尾中有SLC16A2、SLC7A1和SLC2A9等17个DEGs呈上调表达，SLC39A4、SLC26A3和SLC40A1等15个DEGs呈下调表达;在附睾体vs附睾尾中有SLC5A3、SLC16A2和SLC46A3等6个DEGs呈上调表达，SLC25A20、SLC20A2和SLC27A1等6个DEGs呈下调表达。通过关联网络分析筛选出13个关键基因:SLC41A2、SLC7A8、SLC26A3、SLC39A11、SLC30A4、SLC1A1、SLC7A2、SLCO2A1、SLC6A2、SLC22A17、SLC5A5、SLC22A18和SLC30A4。其中，SLC26A3基因是附睾头vs附睾体、附睾头vs附睾尾2组样本的关键基因，且SLC26A3基因在附睾头的相对表达量显著高于附睾体和附睾尾(P<0。05)。牦牛附睾SLC基因家族在矿物质吸收通路上富集的数量最多，其中SLC26A3基因参与矿物质吸收和胰腺物分泌2条信号通路。[结论]从牦牛附睾不同区段上皮细胞中筛选得到13个SLC基因家族调控基因，其中SLC26A3基因是附睾头vs附睾体、附睾头vs附睾尾2组样本的共有关键基因，通过调控矿物质吸收而影响雄性牦牛的生殖能力。

    牦牛附睾上皮细胞SLC基因家族差异表达基因(DEGs)

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    镉胁迫对合浦珠母贝C型凝集素基因表达及部分生理指标的影响

    刘忠华陈洁黄晓玲涂淏天...
    3414-3425页
    查看更多>>摘要：[目的]明确合浦珠母贝对镉胁迫的免疫响应机制，为丰富贝类的免疫生物学研究提供理论基础。[方法]以2龄合浦珠母贝为研究材料，通过RACE克隆合浦珠母贝的2个C型凝集素(CTL)基因(PmCTL1和PmCTL4)，并采用实时荧光定量PCR检测这2个基因在合浦珠母贝各组织中的表达情况。以4。0 mg/L氯化镉(CdCl2)溶液对合浦珠母贝进行胁迫，分别于胁迫0、3、6、12、24和48 h后采集肝胰腺及血淋巴组织，检测肝胰腺中的PmCTL1和PmCTL4基因表达情况及血清酸性磷酸酶(ACP)、过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)的活性变化;同时以0。5 mg/L氯化镉溶液胁迫21 d，观察统计合浦珠母贝肝体指数(HSI)的变化趋势。[结果]克隆获得的PmCTL1、PmCTL4基因cDNA序列全长分别为853和1113 bp，对应的编码蛋白各含有1个典型的CRD结构域，且CRD结构域中均含有6个保守的半胱氨酸，与其他软体动物的相似性较高。PmCTL1和PmCTL4基因在合浦珠母贝的肝胰腺、性腺、闭壳肌、鳃和外套膜等组织中均有表达，但二者具有不同的组织表达分布特征;肝胰腺中PmCTL1和PmCTL4基因相对表达量随镉胁迫时间的推移呈明显的波动变化趋势，在镉胁迫6 h时二者的相对表达量均最低，PmCTL1基因在镉胁迫3 h时达最高值[约是镉胁迫前(0 h)的3。23倍]，PmCTL4基因在镉胁迫12 h时达最高值[约是镉胁迫前(0 h)的2。03倍]。合浦珠母贝血清ACP活性在镉胁迫24 h时达最高值，CAT活性在镉胁迫6 h时达最高值，SOD活性在镉胁迫3 h时达最高值;合浦珠母贝HSI随镉胁迫时间的推移而逐渐下降。[结论]在镉胁迫下合浦珠母贝发生明显的免疫应激，PmCTL1、PmCTL4基因及血清ACP、CAT和SOD均能响应镉胁迫，即CTL和血清酶类在贝类的镉解毒过程中发挥重要作用，且主要发生在肝胰腺组织中。

    合浦珠母贝镉胁迫C型凝集素(CTL)肝胰腺酶活性肝体指数(HSI)

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