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期刊信息/Journal information
中华实验和临床病毒学杂志
中华实验和临床病毒学杂志

洪涛

双月刊

1003-9279

bianjibu2005@sina.com

010-63540009

100052

北京市宣武区迎新街100号

中华实验和临床病毒学杂志/Journal Chinese Journal of Experimental and Clinical VirologyCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>1987年10月创刊,中国科协主管,中华医学会主办。本刊是医学病毒学专业学术期刊,报道医学病毒学的应用及基础理论研究,人类病毒性疾病预防。栏目:述评、人物述林、病毒学、医学微生物学、传染病学、流行病学、儿科学、免疫学、肿瘤学、分子生物学临床免疫、病毒检测、医药信息等。读者为本专业科研人员、老年医学等学科的科技工作者,从事医学病毒学研究的科研人员;高、中等医药院校的有关教学人员;病毒性传染病的临床医师;生物制品工作者;各级卫生防疫工作者;临床检验工作者,以及与人畜共患病毒性疾病防治有关的基层工作者。
正式出版
收录年代

    安徽省2020年柯萨奇病毒A组4型分离株全基因组序列分析

    刘以诺葛盈露杨灵康孙永...
    269-278页
    查看更多>>摘要:目的 了解安徽省柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CV-A4)毒株全基因组序列变异及分子进化情况,为今后手足口病的病原学监测和科学防治提供理论依据.方法 采用一代测序法对2020年5株CV-A4分离株进行全基因组测序.运用MEGA11.0对5株CV-A4分离株,32株CV-A4代表株和肠道病毒A71型(Enterovirus A71,EV-A71)原型株BrCr基于VP1区构建系统进化树,对分离株以及肠道病毒A组(enterovirus A,EV-A)原型代表株基于P1、P2、P3区分别构建系统进化树;选用DNAStar进行毒株VP1区氨基酸序列比对,使用BioEdit7.2进行氨基酸置换熵分析并作氨基酸位点熵值图,使用SimPlot3.5和RDP4对CV-A4分离株和EV-A原型代表株进行重组分析,使用DnaSP6软件进行分离株和参考代表株的选择压力分析.结果 系统进化树显示:分离株属于C2亚型,与中国大陆地区流行的CV-A4毒株属于同一分支,C2亚型分支的毒株氨基酸序列同源性为97.30%-100%,分离株同原型相比,均有6个氨基酸变异位点.选择压力分析表明C2亚型的CV-A4毒株受负选择压力的影响,置换熵分析编码区氨基酸序列有25个易突变位点,占比1.14%,毒株进化主要依赖重组.重组分析表明分离株在P2、P3区域与多种EV-A原型株发生不同区段的重组,与CV-A5原型株重组区段较长,尤其在3A-3C区段,P1是相对保守的区段.结论 安徽省CV-A4在P2、P3区与其他EV-A原型株发生频繁重组事件,应对安徽省CV-A4的分子进化研究继续保持密切关注.

    柯萨奇病毒A组4型全基因组系统进化分析

    不同类型文章的撰写要求

    编辑部
    278页

    2021-2022年绵阳地区流感样病例样本中的鼻病毒特征分析

    宫悦潘明陈果宋芹芹...
    279-285页
    查看更多>>摘要:目的 了解绵阳地区的流感样病例患者的鼻病毒(human rhinovirus,HRV)流行情况及病原特征.方法 收集2021-2022年绵阳地区哨点医院呼吸道感染且诊断为流感样病例(influenza-like illness,ILIs)患者的咽拭子,采用实时荧光定量PCR技术对16种常见病原体进行检测.巢氏PCR扩增HRV阳性样本的VP4/VP2编码区基因.从GenBank数据库下载国内外各血清型代表株进行系统发育、一致性及氨基酸变异分析.结果 共采集绵阳地区ILIs样本332例,病毒检出率为58.73%(195/332).其中HRV阳性样本23例,检出率为6.92%(23/332),成功扩增出18条HRV流行株序列.经比对发现绵阳地区ILIs病例流行的HRV涉及13种血清型,分属于HRV-A(12种)、HRV-B(5种)和HRV-C(1种)3种基因型.同源性分析表明其核苷酸和氨基酸相对保守,但与参考株相比,HRV-A型和HRV-B型存在多处变异.结论 HRV是2021-2022年绵阳地区ILI感染的病原体之一,以HRV-A型为主.

    流感样病例鼻病毒病原特征遗传进化

    四川省1株猪獾传播狂犬病病毒全基因组序列测定及分析

    钟红荣蒋明凤冯玉亮周兴余...
    286-293页
    查看更多>>摘要:目的 对四川省一例由野生动物(猪獾)咬伤发病的疑似狂犬病病例的唾液标本进行狂犬病病毒的全基因组序列测定,从分子水平对病毒进行遗传变异特征分析,了解四川省野生动物狂犬病病毒的流行和变异情况.方法 从疑似狂犬病病例的唾液标本中提取总病毒RNA,采用PCR的方法以特异性引物进行狂犬病病毒序列扩增,将获得的基因片段进行测序,并运用生物学软件将所得序列进行拼接从而得到狂犬病病毒株的全基因组序列.对全基因组进行遗传变异特征分析.结果 经测序获得1株猪獾源狂犬病病毒(以下简称SCR23-052)全基因组核苷酸序列,经NCBI在线BLAST及与多个参考序列比对表明,SCR23-052全基因组序列的组成和结构符合弹状病毒科狂犬病毒属特征;分别与宁夏毒株(J)、重庆毒株(CQ92、02050CHI)之间各个基因区域核苷酸与氨基酸序列相似性最高,SCR23-052基因组序列差异性在氨基酸水平明显低于核苷酸水平,说明蛋白质编码基因的核苷酸变异大多属于同义突变.种系发生分析显示SCR23-052属于基因V型,其糖蛋白主要抗原位点未见明显突变,在线网址预测糖蛋白在第56和338位发生了氨基酸糖基化,SCR23-052与参考疫苗株CTN181的信号肽序列相比氨基酸差异最少.本研究病毒在核蛋白主要抗原位点与所有参考疫苗株均发生了相同的突变(332位A→T),在B细胞表位仅与参考疫苗株CTN181相比发生了 379位L→V的突变,SCR23-052与基因Ⅴ型的参考毒株在核蛋白研究位点均一致.结论 获得了 1株野生动物猪獾源基因Ⅴ型狂犬病病毒株全基因组序列,不同于四川以往报道流行的犬源狂犬病病毒基因Ⅰ型毒株.SCR23-052与各参考株基因组序列相比有不同程度差异,但主要毒力特征未改变.

    狂犬病病毒猪獾全基因组序列分析

    2023年重庆市城市污水新冠病毒监测结果

    刘高敏郑吉琴陈瑶唐文革...
    294-298页
    查看更多>>摘要:目的 为了弥补传统大规模人群监测的不足,在新冠疫情爆发初期提供预警信号,重庆市自2023年起开展城市污水新冠病毒监测工作.方法 新冠病毒"乙类乙管"后,选择了重庆主城4个区5个有自动样本采集设施的污水处理厂作为监测点,每周每个污水处理厂各采集2份污水,用铝盐沉淀法进行富集浓缩,应用多重实时荧光RT-PCR方法对新冠病毒进行检测和分析.结果 2023年1月16日至12月31日累计监测城市污水496份,其中新冠病毒核酸检测阳性285份,总检出率57.46%.第3~5周、18~21周、40~47周新冠病毒检出率均为100.00%.城市污水中新冠病毒核酸浓度在第18周达到高峰,随后开始下降,进入低水平、波动流行期,污水监测新冠病毒核酸日均浓度与传染病监测系统显示的每日新增新冠感染者数、发热门诊新冠阳性检出率的变化趋势基本吻合.结论 重庆市城市污水中新冠病毒的检出率较高,尤其是4~5月份,污水监测可以间接反映新冠病毒感染状况.

    铝盐沉淀法污水监测新冠病毒多重实时荧光RT-PCR

    2021-2022年杭州新型冠状病毒阳性病例中人鼻病毒的共感染特征分析

    程实于新芬曹飞飞周银燕...
    299-303页
    查看更多>>摘要:目的 了解新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)阳性病例中人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)的共感染特征及系统进化特征.方法 使用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,qPCR)对 7 213 份 2019-nCoV 核酸阳性样本进行了包括HRV在内的10种常见呼吸道病毒检测,分析其共感染特征;对HRV核酸阳性样本进行了 VP4/VP2基因片段测序并构建进化树,分析其系统进化特征.结果 2019-nCoV核酸阳性样本中合并HRV感染最多,为97例,阳性率1.34%;其次是普通冠状病毒(coronavirus,CoV),为36例,阳性率0.50%.HRV共感染率与其他病毒相比,差异具有统计学意义(x2=318.09,P<0.001).18岁以下组HRV共感染率最高,差异具有统计学意义(x2=36.77,P<0.001).共感染HRV未呈现明显季节性.其中39株HRV基因片段测序成功(39/97,40.21%),进化树分析表明,10株被划分到HRV-A组,9株被划分到HRV-B组,20株被划分到HRV-C组.39份样本共检测到17个血清型,其中B6和C15为优势血清型,分别为6株(HRV-B中占比66.67%)和14株(HRV-C中占比70%),其他血清型呈散在分布.结论 HRV是2019-nCoV核酸阳性病例中共感染率最高的病毒类呼吸道病原体,共感染率在18岁以下组最高.杭州地区2019-nCoV阳性病例中共感染的HRV-A组、HRV-B组和HRV-C组均有发现,血清型呈现多样性.

    新型冠状病毒人鼻病毒共感染

    七种新型冠状病毒候选标准株的筛选和评价

    周平平彭晓放黎薇邓小玲...
    304-310页
    查看更多>>摘要:目的 制备新型冠状病毒野生株(WT)、Beta变异株、Delta变异株、Omicron变异株(BA.2、BA.5、BQ.1和XBB.1分支)等7株单克隆病毒株,用于申请国家标准株.方法 利用蚀斑纯化技术感染Vero细胞后筛选单克隆毒株,通过观察细胞病变特性与病毒形态学特征、病毒滴度与全基因组序列测定、支原体检测等方法,以评价单克隆毒株的基础生物学特征.结果 WT株、Beta变异株、Delta变异株、Omicron变异株(BA.2、BA.5、BQ.1和XBB.1)7株病毒感染细胞后,细胞病变表现为细胞圆缩脱落;蚀斑纯化后的病毒支原体检测均为阴性,2代至5代的病毒滴度在105~108 TCID50/ml之间;电镜下病毒颗粒呈圆形或者椭圆形,直径在60~140 nm之间;全基因组测序与系统进化分析明确了 7种毒株的变异株类别,证实了单克隆毒株连续传代5代基因组特征稳定.结论 制备7种代表性新型冠状病毒变异株的克隆株,具有典型冠状病毒细胞病变效应、形态结构清晰、病毒活性良好、遗传稳定等特性,可作为候选毒株用于申请国家标准株.

    新型冠状病毒蚀斑纯化标准株

    狂犬病防控重点号即将刊出

    中华实验和临床病毒学杂志编辑部
    310页

    2019-2020年冬春季麻城市社区季节性流感病毒感染率血清学队列研究

    范津菘占建波陈悦董少波...
    311-318页
    查看更多>>摘要:目的 确定社区内有血清学证据的各亚型/系季节性流感病毒感染率,分析影响季节性流感病毒感染的因素.方法 在2019年11月(即流感流行季节前)麻城市15个村/街道招募6~59岁居民建立队列,开展横断面基线调查,采集血清,收集人口学及儿童防护知识、行为、态度等信息,在次年7月(即流感流行季节后)进行横断面随访调查,再次采集血清.两次调查配对血清通过血凝抑制(haemagglutination inhibition,HI)试验或微量中和(micro-neutralisation,MN)试验,使用各亚型/系流感病毒流行代表株作为抗原,测定流感病毒特异性抗体,如果抗体有四倍或以上增高,确定为感染.运用单因素和多因素Logistic回归分析感染A(H3N2)、B/Victoria流感病毒的影响因素.结果 2019年11月,队列纳入800名研究对象,包括340名6~17岁儿童和460名18~59岁成年人,2020年7月随访到605名研究对象(包括224名儿童、381名成人)并获得了流行季节前后配对血清.25.3%(153/605)的研究对象至少感染过一种亚型/系的季节性流感病毒.儿童各亚型/系流感病毒总感染率为44.2%(95%CI:37.6%~50.8%)显著高于成人的感染率14.1%(95%CI:10.7%~17.7%).儿童的A(H3N2)流感病毒感染率最高,其次为B/Victoria.流感流行季节前A(H3N2)[OR=0.88(95%CI:0.84~0.93)]、B/Victoria[OR=0.97(95%CI:0.95~0.99)]病毒的 MN 或 HI 抗体水平与儿童是否感染该亚型/系流感病毒相关.结论 2019-2020冬春季节麻城市6~59岁居民季节性流感病毒感染率较高,近50%的6~17岁儿童感染过季节性流感病毒.流行季节前较高的HI/MN抗体水平可能降低A(H3N2)和B/Victoria流感病毒的感染风险.

    季节性流感队列研究血凝抑制试验抗体滴度

    基于一体化系统流感病毒快速检测技术的建立

    张小山马晶郝彦哲杨靖...
    319-325页
    查看更多>>摘要:目的 本研究旨在开发一种快速、准确的流感病毒一体化核酸检测方法.方法 设计了针对近年来国内流感病毒主要流行株的特异性引物和探针,将其与提取、扩增试剂和即时检测(point of care test,POCT)系统整合,实现针对流感病毒的核酸提取、反应体系配制、扩增反应和结果判读功能的快速一体化病毒核酸检测流程.使用培养的流感病毒对检测体系进行检测下限测试,并对检测体系进行特异性测试.结果 成功设计了甲型和乙型流感病毒的二重扩增引物和探针,实现了 500拷贝/ml的检测下限,并通过特异性测试验证了检测试剂对腺病毒、呼吸道合胞病毒等其他呼吸道病原体无交叉反应.本研究建立的基于POCT技术的流感病毒核酸快速检测方法,可以实现在50 min内完成核酸提取、扩增和结果判读检测全流程,同时可以实现检测数据的实时上传.结论 开发的基于POCT技术的流感病毒快速检测试剂盒,实现了"样品进、结果出"的便捷操作,适合在基层医疗机构中快速检测流感病毒,具有重要的临床应用价值.

    流感病毒核酸检测即时检测技术