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期刊信息/Journal information
生物学杂志
生物学杂志

宋礼华

双月刊

2095-1736

swxzz@163.com

0551-62673629

230001

安徽省合肥市花园街83号合肥大厦9楼

生物学杂志/Journal Journal of BiologyCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是生命科学的综合性学术期刊，主要刊登动物、植物、微生物及其生理、生化、遗传和生物技术、生物工程、分子生物学、生物教学等方面的文章。
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    非经典模式生物——耐格里阿米巴研究进展

    徐嘉曦杨清林魏泽林徐国良...
    1-7页
    查看更多>>摘要：模式生物作为选定的物种用于揭示具有普遍规律的生物学现象.传统上只有少数生物被广泛研究,但现代研究工具使得研究人员能够扩展现有的研究对象,包括较少研究和更不寻常的生物.阿米巴作为一种自由生活的原生生物,由于其易于区分的爬行阿米巴状态和游动鞭毛体状态,长期以来被视为基体和鞭毛体组装的研究模型.最近,耐格里阿米巴全基因组测序提供了新的研究视角.着重介绍其基因组测序揭露的新功能和生物学特征,包括兼性厌氧代谢、广泛的级联信号通路、原始生物学进化地位和分化,从而为开展非经典模式生物研究提供新颖的视角和参考.

    非经典模式生物耐格里阿米巴基因组代谢信号通路

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    基于基因组规模代谢模型探究影响肝癌细胞生长的关键基因

    徐轶舟王卓
    8-13页
    查看更多>>摘要：基于全基因组规模代谢模型的模拟分析已被成功应用于探索包括癌症在内的多种疾病的发生机制,通过模拟基因敲除对肿瘤细胞生长的影响,鉴别关键代谢重编程节点.通过分析肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)不同于正常肝细胞的代谢差异,发现AKG能够调节肿瘤生长,是潜在的抗癌药物靶点;而TECR在HCC细胞中的重要性降低使其成为潜在的抗肿瘤位点.HCC肝癌细胞在胆固醇合成通路上存在代谢重编程:DHCR24和HMGCS2基因的缺失可以帮助肿瘤细胞避免正常凋亡,而IDI2基因的存在能够增强肿瘤细胞增殖、迁移能力;胆碱代谢物可以影响脂肪酸合成通路从而促进炎症反应来加速癌症发展的进程.

    全基因组规模代谢模型肝细胞肝癌基因敲除胆固醇合成L-氯化棕榈酰肉碱

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    IRF6调控IFN-β的功能验证与结构研究

    魏迪洋闫利明李巍然贾绮林...
    14-17页
    查看更多>>摘要：利用X射线衍射晶体学方法解析IRF6蛋白的三维结构,同时验证IRF6对干扰素-β 的转录调控作用,为IRF6蛋白的结构生物学研究提供基础.研究利用高通量基因克隆、蛋白表达与纯化获得大量的IRF6 N端蛋白结构域可溶性表达.凝胶迁移试验(EMSA)结果显示,IRF6 N端结构域可与干扰素-β启动子核酸片段形成蛋白-核酸复合体,具有明确的相互作用.将孵育后的蛋白-核酸复合体进行悬滴气相扩散法晶体筛选与优化后获得了X射线衍射分辨率达2.68Å的晶体,为进一步揭示IRF6蛋白三维结构提供了帮助.验证了IRF6具有结合干扰素-β启动子元件特定片段的N端结构域,可调控干扰素-β的转录与表达,并通过IRF6 N端结构域与干扰素-β启动子核酸片段共同孵育后获得高分辨率蛋白晶体,以解析IRF6蛋白三维结构.研究结果对IRF6相关疾病机制研究及干扰素相关免疫通路的调控机制有重要意义.

    干扰素调节因子6干扰素-β蛋白纯化蛋白结晶

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    联合CGGA-TCGA数据库挖掘胶质瘤显著生存相关基因

    吕俊杰张一骅邓贵刘佳欣...
    18-22页
    查看更多>>摘要：利用CGGA与TCGA数据库,挖掘胶质瘤预后标志相关基因,结合差异分析、生存分析、共表达分析、临床相关性分析和ROC曲线评估预测能力,并通过TCGA验证,得到PLAT、IGFBP2、BCAT1和SERPINH1等4个可以作为独立预后标志因子的基因.分析表明,这4个基因不仅是独立的预后因子,还在不同人群中都具有较好的预后预测能力,说明找到的预后基因具有潜在的应用价值.对SERPINH1剪接事件进行分析,揭示可变剪接事件是影响患者预后的重要因素,这为进一步理解胶质瘤预后基因的特征提供了依据.

    胶质瘤生存分析预后因子选择性剪接

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    基于药物重定位策略预测治疗多发性骨髓瘤的候选化合物

    邹敏李锐峰陈岷颜晓燕...
    23-28页
    查看更多>>摘要：采用药物重定位(Drug repositioning,DR)策略预测多发性骨髓瘤的候选化合物,为多发性骨髓瘤的治疗提供新的思路和方向.利用GEO数据库检索并筛选多发性骨髓瘤表达谱芯片数据,GEO2R软件提取差异表达基因(DEGs);DAVID和Panther数据库对差异表达基因进行富集和通路分析;利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络分析;将差异表达基因导入CMAP连接图,计算获得治疗MM的候选化合物,进一步对候选化合物进行查找和分析.结果显示:共获得差异表达基因53个,包括上调差异表达基因10个、下调差异表达基因43个;GO分析结果表明生物学过程涉及22个功能簇,分子功能涉及5个功能簇,细胞成分涉及5个功能簇;KEGG分析涉及10条通路;蛋白-蛋白相互作用网络分析显示VCAM1、CCR2、CCL3和CXCL12等4个基因为富集程度最高的核心差异表达基因;通过CMAP连接图计算得到排名前20的候选化合物,其中LY-294002和Tanespimycin可能对MM有潜在治疗作用,但还有待深入试验研究和临床验证.

    药物重定位多发性骨髓瘤差异表达基因候选化合物生物信息学

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    shRNA靶向干扰UL27、UL54基因对HSV-2复制的影响

    潘晓瑜吕延成宋其芳韩晋辉...
    29-32页
    查看更多>>摘要：为探讨单纯疱疹病毒-2型(Herpes simplex virus type 2,HSV-2)UL27、UL54基因的重组表达载体shRNA(small hairpin RNA,shRNA)联合干扰对HSV-2复制的影响,将重组质粒表达载体转染HEK293细胞,利用流式细胞术检测重组质粒转染HEK293的效率,实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)和蛋白免疫印迹(Western Blot)方法检测UL27、UL54基因及其蛋白的表达情况.此外,采用TICD50(50％tissue culture infective dose,TCID50)法和噻唑蓝(methyl thiazolyl terazolium,MTT)比色法检测病毒的滴度变化和HEK293细胞的存活率.结果检测显示:UL27 shRNA75+UL54shRNA1081联合干扰组的UL27、UL54基因mRNA的表达抑制率分别为(88.10±1.95)％和(85.53±2.28)％,gB蛋白、ICP27蛋白表达及子代病毒滴度均明显降低,HEK293细胞的存活率为(97.30±2.91)％,与单干扰组比较差异均有统计学意义(P<0.05).说明UL27shRNA75和UL54 shRNA1081这两个靶点联合干扰能显著抑制HSV-2在HEK293细胞中复制,为今后的HSV-2多基因的治疗提供研究基础.

    人疱疹病毒2型小分子干扰RNAUL27基因UL54基因

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    胸腺肽诱导Hela细胞死亡的研究

    李亚琳魏睿史秀超
    33-35页
    查看更多>>摘要：为了研究胸腺肽Tα1对肿瘤细胞的生长抑制效应,试验检测了Tα1在体外对宫颈癌Hela细胞生长增殖的影响.不同浓度Tα1处理Hela细胞24 h或48 h,用显微镜观察Hela细胞生长的形态学变化,MTT法检测细胞死亡率.采用实时定量PCR以及Western Blot检测自噬相关因子lc3基因及其蛋白的表达,进一步了解细胞死亡的行为.结果表明,用不同浓度的Tα1处理Hela细胞,在10～30μg/mL浓度范围内,随着Tα1含量的增高,Hela细胞的死亡率明显增加,同时LC3的表达量也显著升高,且与药物剂量呈正相关.这些结果说明Tα1在一定剂量范围内,能够在体外通过自噬的方式诱导Hela细胞死亡.

    Hela细胞Tα1肿瘤自噬

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    植物乳杆菌UD01对具核梭杆菌生物膜形成的抑制

    钟焱婷杨虹
    36-40页
    查看更多>>摘要：为了筛选在口腔中性pH条件下仍能抑制具核梭杆菌生物膜形成的益生菌,用源于不同益生菌的pH 6.6无细胞发酵上清液(Cell-free supernatant,CFS)处理具核梭杆菌,通过结晶紫半定量法测试其抑制具核梭杆菌生物膜形成的能力,从而筛选出一株抑制效果突出的植物乳杆菌UD01.微量倍比稀释法测定UD01CFS(pH 6.6)对具核梭杆菌生物膜形成的最低抑制浓度(The minimum biofilm inhibition concentration,MBIC)为250μL/mL.扫描电镜和激光共聚焦显微镜结果显示:UD01 CFS(pH 6.6)处理下具核梭杆菌生物膜结构疏松、厚度变薄.生长曲线、外膜黏附相关基因表达以及胞外聚合物(Extracellular polymeric substances,EPSs)含量变化表明,UD01 CFS(pH 6.6)并不能抑制具核梭杆菌生长,其可能的作用机制是通过下调黏附相关外膜蛋白基因的表达、减少胞外蛋白和多糖的分泌,从而降低具核梭杆菌黏附能力,最终达到抑制生物膜形成的目的.

    口臭具核梭杆菌益生菌生物膜黏附能力

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    基于前导肽和成熟区共进化提高米黑霉脂肪酶热稳定性研究

    王珏胡丽丽张育敏吴娜...
    41-45页
    查看更多>>摘要：研究结合理性设计和定向进化技术,通过2轮易错PCR、2次定点突变和4轮定点饱和突变提高米黑霉脂肪酶(Rhizomucor miehei Lipase,RML)的热稳定性,共得到9株理想的脂肪酶突变体,在经70℃热处理2 h后,均能保留对甘油三酯的水解活性.以M9(D48V/V67A/S168P/S240A/S311C/D313H)的热稳定性最佳,热处理后保留活性可达(1316±31)U/mg,这一数据是野生型RML常温水解活性的5.2倍(野生型RML经热处理后完全失活).经测序分析,突变位点D48V和V67A位于目的基因前导肽上,S168P、S240A、S311C和D313H位于目的基因成熟区,且对前导肽上的两个突变点进行饱和突变后,突变体的热稳定性会发生改变,说明前导肽的突变会影响RML全基因的热稳定性,因此,RML热稳定性得以提高是源于其前导肽和成熟区的共进化作用.

    前导肽基因突变米黑霉脂肪酶热稳定性

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    基于matK和rbcL序列的石斛属植物亲缘关系研究

    林晓霞鹿炎李会丽周苹...
    46-50页
    查看更多>>摘要：采集了中国6个省份的铁皮石斛种质资源共22份,通过叶绿体基因matK和rbcL进行克隆测序,同时结合已报道的近缘物种matK序列33个和rbcL序列30个进行系统进化分析及分子鉴定.序列结果显示:matK基因序列平均长度为1708 bp,GC含量32％,保守位点768个,简约信息位点871个;rbcL基因序列平均长度1332 bp,GC含量42.9％,保守位点802个,简约信息位点24个.遗传多样性分析表明:matK序列单倍型数量(H)32个,单倍型多态性水平(Hd)0.842,核苷酸多态性(π)0.27016;rbcL序列H为10个,Hd为0.664,π为0.02611;序列分析及遗传多样性显示matK序列的分析结果具有更大的遗传多样性.遗传聚类结果显示不同产地的铁皮石斛与已有报道的石斛属各聚一支,相同产地铁皮石斛的聚类结果也与其地理分布基本一致.matK序列作为石斛属系统进化关系及亲缘关系分析具有更高的遗传多样性;中国6个省份铁皮石斛种质资源在进化上也具有一定的地域性特征.

    石斛属铁皮石斛叶绿体基因系统进化树

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