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节旋藻硝酸盐转运蛋白基因Amnrt P序列分析

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应用生物信息学软件对获得的节旋藻硝酸盐转运蛋白基因(Amnrt P)全长序列进行了结构特征、同源性比较、多序列比对、系统发育学分析等。结果表明:该基因全长为1515 个核苷酸，编码 504 个氨基酸，平均 GC 含量为43。8%，疏水氨基酸的比例为47。6%。该硝酸盐转运蛋白含有 12 个跨膜结构域(Transmembrane domains，Tm)，膜拓扑结构与 NRT2 家族的类似，并发现了多个 NRT2 家族的保守序列。同源性搜索显示与属于 NRT2 基因家族的海洋蓝藻的氨基酸序列相似性为75%～89%。采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)构建了分子系统树，结果表明 3 种树的拓扑结构基本相似，并且在蓝藻中基于硝酸盐转运蛋白基因的系统发育关系与形态学分类结果相一致。所获 Amnrt P 基因属于 NRT2 基因家族，可成为蓝藻系统进化研究的分子标记，并为了解节旋藻中硝酸盐吸收与转运的基因结构和分子机制奠定了一定的基础。

凌娜、茅云翔、隋正红、邵林、张学成

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哈尔滨商业大学生命科学与环境科学研究中心,哈尔滨,150076

中国海洋大学海洋生命学院,青岛,266003

节旋藻 硝酸盐转运蛋白(NRT) 硝酸盐转运蛋白基因(AmnrtP) 序列分析 系统发育

国家自然科学基金国家自然科学基金中国科学院重点实验室基金

302002083057141830571418

2008

参考文献相关文献
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同作者其他文献同项目成果
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[4]徐民俊,茅云翔,张学成.条斑紫菜铁氧还蛋白亚基Ⅰ基因(FdⅠ)克隆与序列分析[C]. //国家“863”计划资源环境技术领域第三届海洋生物高技术论坛论文集.2005:658-661.
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[1]茅云翔,凌娜,王广策,等.极大节旋藻(Arthrospira maxima)高分子量基因组文库构建及其应用[J].高技术通讯,2007,17(2):191-196.
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高技术通讯
中国科学技术信息研究所

高技术通讯

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.19
ISSN：1002-0470
年,卷(期)：2008.18(1)
凌娜,茅云翔,隋正红,等.节旋藻硝酸盐转运蛋白基因Amnrt P序列分析[J].高技术通讯,2008,18(1):97-103.
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