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期刊信息/Journal information
分子植物育种
分子植物育种

张启发

双月刊

1672-416X

mpb@sophiapublisher.com

0898-68966415

570206

海南省海口市海秀大道128号双岛公寓13B室

分子植物育种/Journal Molecular Plant BreedingCSCD北大核心CSTPCD
查看更多>>本刊是由国家科技部批准，国家新闻出版署核准的刊物。本刊“立足国内，面向国际”，是一份为转基因育种、分子标记辅助育种及常规育种服务的国际化科学杂志。围绕水稻、小麦、玉米、油菜、大豆、棉麻、薯类、果树、蔬菜、花卉、茶叶、林草等，刊登分子遗传育种理论、分子育种方法、分子育种研究动态以及优良种质培育等方面的科学论文报道。
正式出版
收录年代

    川西獐牙菜SmC4H基因的生物信息学分析和表达分析

    胡月赵舒媛张亚美贾榕...
    2528-2536页
    查看更多>>摘要：由SmC4H基因编码的肉桂酸-4-羟基化酶是川西獐牙菜苯丙烷途径的关键酶.本研究从川西獐牙菜的转录组数据中获得了 SmC4H基因的全长cDNA序列,通过RT-PCR进行该基因的克隆鉴定,利用生物信息学软件对该基因进行预测分析,并通过RT-qPCR检测该基因的组织表达差异和不同胁迫处理条件下的表达情况.生物信息学分析结果显示SmC4H基因cDNA全长1 518 bp,编码505个氨基酸,相对分子质量为51.83 kD,为亲水性较强的不稳定蛋白,二级结构由47.52％α-螺旋、14.06％延伸链、4.95％β-转角和33.47％无规则卷曲构成,预测该蛋白可能不具有跨膜结构,不含有信号肽,属于p450超家族.SmC4H蛋白的相似性与其他植物的C4H蛋白较高,其中与美女樱(Glandularia×hybrida)的相似性最高.RT-qPCR结果显示,SmC4H基因在根、茎、花、叶中均有表达,表达量根＞茎＞花＞叶,硝普钠(SNP)、赤霉素(GA3)和脱落(ABA)在一定程度上能使SmC4H基因的表达上调.此结果为进一步研究该基因在川西獐牙菜苯丙烷途径中的功能和通过基因工程手段提高咕吨酮化合物产量奠定了基础.

    川西獐牙菜肉桂酸-4-羟基化酶基因克隆生物信息学分析表达分析

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    马尾松PmMADS13基因的克隆与表达分析

    田雅婷叶友菊倪州献胥猛...
    2537-2543页
    查看更多>>摘要：SOC1/TM3是MADS-box家族一员,它能介导多条开花途径的信号整合,从而调控开花的时间和花器官的发育.为了解SOC1类基因在马尾松生殖生长中的作用,从转录组测序结果中筛选到一条SOC1类同源基因,设计特异性引物,采用cDNA末端快速克隆(RACE)技术,获得该基因的全长cDNA序列为1 147bp,包括666bp的开放阅读框(ORF),共编码220个氨基酸,命名为PmMADS13.氨基酸序列比对分析表明,此蛋白包含典型的MADS-box和K-box结构域,C末端具有高度保守的SOC1 motif基序;进化树分析表明马尾松PmMADS13与油松的DAL9基因、辐射松的MADS9基因、火炬松的MADS13基因的亲缘关系最近,属于SOC1/TM3亚家族;RT-PCR分析显示,PmMADS13在马尾松生殖器官雌花、雄花中均有高表达,其次是茎端和针叶,在根部组织中的表达量最低.推测PmMADS13是参与马尾松成花的重要基因.

    马尾松PmMADS13基因克隆表达分析

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    樟叶木防己叶绿体基因组特征分析

    苏永精谢澳温海成韦威...
    2544-2554页
    查看更多>>摘要：为探讨樟叶木防己(Cocculus laurifolius)叶绿体基因组特征及与同科属叶绿体基因组的系统发育关系.采用Illumina HiSeq 4000平台对樟叶木防己进行测序、组装和注释,并对其序列特征、密码子偏好性、重复序列、简单重复序列、系统发育进行分析.结果表明,樟叶木防己叶绿体基因组呈典型的四分体结构,总长度为157 961 bp,包括大单拷贝区长度为89173 bp,小单拷贝区长度为20198bp,反向互补重复区长度为24295 bp;共有基因129个,其中蛋白质编码基因85个,tRNA基因36个和rRNA基因8个;密码子偏好性分析表明,亮氨酸(Leu)的密码子数量最多(4 920个),而半胱氨酸(Cys)的密码子数量最少(568个);从樟叶木防己叶绿体基因组中共检测出26个长重复序列及65个SSR位点;系统发育分析表明,樟叶木防己与粉防己(Stephania te-trondra)聚为一支,亲缘关系最密切.本研究为防己科和木防己属分子标记、物种鉴定、亲属关系解析、遗传多样性分析等研究提供科学依据.

    樟叶木防己叶绿体基因组密码子偏好性重复序列系统发育

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    细基江蓠线粒体基因组密码子偏好性分析

    邱春桃梁芳梅吕颖王鹏良...
    2555-2563页
    查看更多>>摘要：以细基江蓠为研究对象,选取其线粒体基因组序列中以AUG为起始密码子且长度大于300 bp的22条非重复序列来进行密码子偏好性分析.结果表明:密码子第3位的平均GC含量为14.60％;ENC的分布范围为28.48～43.36,平均值为36.51;RSCU值＞1的密码子共有29个,且密码子全部是以A或U结尾.中性绘图分析显示,GC12与GC3之间的相关系数为0.297,相关性未达到显著水平;ENC-plot分析发现,大部分基因位于标准曲线的附近;PR2-plot绘图分析显示,密码子第3位碱基含量T＞A、G＞C;对应性分析表明,第1、第2、第3、第4向量轴的贡献率分别为23.96％、11.15％、9.95％和6.38％,第1向量轴与GC、CAI、ENC、GC3s均无显著相关,最终把AUA、CUU、CCA、ACU、GCU、GAA、UGA、CGA、AGU和AGA 10个密码子确定为最优密码子.研究结果为今后优化细基江蓠线粒体基因组密码子,提高表达效率和改良细基江蓠目标性状提供理论基础.

    细基江蓠线粒体基因组密码子偏好性最优密码子

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    花生种质遗传多样性分析及指纹图谱构建

    徐彪牛海龙刘红欣李伟堂...
    2564-2574页
    查看更多>>摘要：本研究利用SSR标记对50份花生种质资源进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建.38对SSR引物在50份种质资源中共扩增出141个基因位点,每个引物平均有3.71个位点,多态性扩增位点126个,多态性比率为89.36％,平均多态性信息含量(PIC)为0.52,变异范围为0.40～0.88;采用UPGMA法进行聚类,在GS 0.648处可将50份花生种质资源聚为4个类群,50份花生种质资源的遗传相似系数(GS)介于0.436～0.955之间,平均值为0.735.此外,利用38对SSR引物构建了一份独特的DNA指纹图谱QR编码,以期为花生新品种分类鉴定、亲缘关系分析以及种质资源的利用奠定理论基础.

    花生(Arachishypogaea)SSR标记遗传多样性聚类分析指纹图谱

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    铁线莲属萼片荧光定量PCR内参基因的筛选和评价

    李桥王淑安王鹏吕芬妮...
    2575-2582页
    查看更多>>摘要：以不同花色的铁线莲属(Clematis L.)栽培品种'恬美'(C.'Sympatia')、'罗兰'(C.'Rooran')、'仙女座'(C.'Andromeda')、'阿拉贝拉'(C.'Arabella')、'普鲁吐斯'(C.'Proteus')以及'路易斯罗维'(C.'Louise Rowe')初花时期的萼片为研究材料,利用RT-qPCR技术检测Atpb、Arp7、Ubc34、Wit1、Cxip4、Cyp71a1和Cyp35a1等7个候选内参基因的mRNA表达情况,并利用软件geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFind-er对7个候选内参基因的稳定性进行综合评估.结果表明,内参基因表达差异显著;利用geNorm软件计算结果为基因Atpb与Cxip4最稳定;利用NormFinder软件计算结果为基因Cxip4最稳定;而BestKeeper软件计算出的最稳定的候选内参基因为Arp7,其次为Atpb;按这3个软件的计算结果,Cyp71a1与Cyp35a1的稳定性均最差,不适合作为内参基因;RefFinder软件分析的最佳的候选内参基因为Arp7.经综合分析,这几个铁线莲品种萼片基因表达的适宜内参基因是Arp7和Atpb.

    铁线莲属实时荧光定量PCR内参基因

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    不同居群蒙古扁桃的遗传多样性SRAP分析

    丁海麦白羽周红兵石松利...
    2583-2589页
    查看更多>>摘要：本研究选取5个具有代表性野生蒙古扁桃种群为研究对象,以同科近属蒙古柄扁桃种群为对照,采用SRAP分子标记方法,对珍稀濒危药用植物蒙古扁桃遗传多样性进行研究,为蒙古扁桃资源的合理保护和可持续利用提供科学的依据.用筛选出的12对SRAP引物,通过优化的反应体系对60个样品进行扩增,共扩增出171个清晰可重复的条带,其中多态性条带有166条,占97.08％.在物种水平上,Nei's基因多样度(h)0.371 1、Shannon信息指数(I)为0.546 8;种群间遗传分化系数(Gst)为0.596 4.结果显示蒙古扁桃居群的遗传变异主要存在于居群间,居群间的遗传分化程度大于居群内的,综合评价贺兰山的蒙古扁桃遗传多样性较高,应当优先保护.

    蒙古扁桃柄扁桃SRAP遗传多样性

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    基于转录组序列的青榨槭EST-SSR标记开发及通用性分析

    穆莹白云海吴静窦德泉...
    2590-2599页
    查看更多>>摘要：青榨槭为目前重要的秋季彩叶园林绿化优良树种之一.本研究基于青榨槭叶片转录组数据进行了SSR标记分析,结果发现其中3 744条unigene序列中含有3 763个SSR位点,发生频率为6.93％,每11.89 kb含一个位点.优势重复序列类型为二核苷酸重复和三核苷酸,分别占总SSR位点的51.21％与46.93％;AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸和三核苷酸的优势重复基元.654对引物中252对(38.53％)引物可成功扩增出目的条带,75对(11.47％)引物表现出多态性.75对多态性引物在槭属16个种质间转移率范围为83.75％～100％,平均转移率为90.08％,表明这75对标记具有较高的通用性.利用转录组开发青榨槭SSR标记可为青榨槭以及槭属种质资源研究、分子标记辅助育种等提供重要的遗传资源.

    青榨槭转录组SSR标记通用性

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    沙地云杉种子内参基因的筛选与验证

    李佳琪白玉娥吉仁花哈布尔...
    2600-2610页
    查看更多>>摘要：为筛选出沙地云杉(Picea mongolica)种子成熟过程中均可稳定表达的内参基因,本研究以沙地云杉种子不同发育时期的样本为研究对象,采用RT-qPCR技术,检测沙地云杉种子转录组数据库中GAPDH、EF1α、CYC、Actin等8个候选内参基因在种子发育过程中呈现的综合表达水平,并通过内参基因分析软件(geNorm,NormFinder,BestKeeper)对其稳定性统一评估.结果表明,候选内参基因中稳定性最好的是CYC、EF1α和GAPDH.分别以CYC、EF1α和GAPDH作为内参基因对沙地云杉胚胎发育关键调控基因LEA1(Late embryogenesis abundant protein)和 WOX9(WUSCHEL related homebox)进行了 定量分析,其表达趋势基本一致.本研究结果将对沙地云杉及近缘物种的分子育种研究提供参考.

    沙地云杉(Piceamongolica)内参基因RT-qPCR基因表达

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    脆木耳转录组EST-SSR标记特征及多态性分析

    王艺琴张素勤郭豪田怀志...
    2611-2619页
    查看更多>>摘要：为开发脆木耳EST-SSR标记,本试验从脆木耳转录组测序数据挖掘SSR位点,并设计引物对木耳DNA进行多态性分析,为木耳的遗传育种提供理论基础.结果发现,在脆木耳转录组的52 954条unigene序列中共搜寻到4 600个SSR位点,SSR发生频率为6.85％,分布频率为8.69％.脆木耳SSR位点共包括112种重复基元;其中,二核苷酸和三核苷酸重复为主要类型,占SSR总数的92.86％.三核苷酸重复最多(66.64％),其优势重复单元为CCG/GGC(8.71％).从设计引物中随机挑选30对进行PCR扩增,6对引物在3份木耳种质中均能扩增出清晰的目标条带.本试验所获得的EST-SSR可为木耳种质资源鉴定、遗传结构分析及遗传图谱构建等提供参考.

    脆木耳EST-SSR特征PCR体系优化多态性

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