期刊,微生物学杂志 2024年卷6期_国家学术搜索

期刊信息/Journal information

微生物学杂志

主　　编：李莉

出版周期：双月刊

国际刊号：1005-7021

电子邮箱：lnwswxh@126.com，lnwsuxh@mail.cyptt.ln.cn

电　　话：0421-2914613

邮政编码：122000

地　　址：辽宁省朝阳市双塔区龙山街四段820号

微生物学杂志/Journal Journal of MicrobiologyCSCDCSTPCD北大核心

查看更多>>本刊是包括工业、农业、医学医药、兽医、食用菌及生物工程学在内的综合性学术刊物，为我国生物学核心期刊，1978年创刊，1987年开始美国《CA》、《SCI》和《中国生物学文摘》等国内外重要检索刊物摘引和收录，主要任务是开展学术交流，反映国内外微生物领域的进展与方向，提高广大微生物学工作者业务水平，为科研工作的正确开展，为生产建设顺利进行，为加速科研成果诞生和立项论证发挥预见性和导向性。同时为加速科研成果转化，指导生产，促进科技致富做出了积极贡献。

正式出版

收录年代

基于CRISPR-Cas系统的微生物基因编辑与调控技术

刘嵘明谭慧萍王晴晴张皓喃...

1-14页

查看更多>>摘要：CRISPR-Cas系统的基因编辑与调控技术为原核和真核微生物的遗传改造提供了高效且精确的工具,显著提升了工业底盘细胞的生产能力和多样性.在原核微生物中,大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒杆菌等工业重要菌株通过CRISPR-Cas系统实现了代谢网络的重构和多基因位点的精确编辑,显著优化了细胞工厂的生产性能.在真核微生物中,酿酒酵母、毕赤酵母、解脂耶氏酵母等模式生物也得益于CRISPR-Cas系统的发展,尤其是CRISPR-Cas9、CRISPR-Cas12a和碱基编辑工具等在基因组精确编辑和调控中的应用,实现了代谢途径的高效优化.高通量基因组编辑技术,如CHASE、CREATE、iCREATE等,结合了CRISPR-Cas系统的强大工具,能够同时对多个基因进行编辑和调控,加速了对复杂表型的优化和代谢网络的解析.本文总结了CRISPR-Cas系统在原核、真核微生物中的应用及其高通量基因组编辑技术的发展,展望了这些技术在工业微生物细胞工厂构建中的潜在应用.

关键词：

CRISPR-Cas系统微生物基因编辑碱基编辑代谢网络高通量基因组编辑细胞工厂

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来自土壤的拟单胞瓶霉属(Phialemoniopsis)2个新记录种

李欣张芝元韩燕峰

15-21页

查看更多>>摘要：调查我国拟单胞瓶霉属(Phialemoniopsis)物种资源.采用经典形态学分类及分子系统学方法对分离获得的菌株进行鉴定.从海南省海口市海南大学海淀校区和江西省吉安市骡子山生态公园的绿化带土壤中采集获得6株拟单胞瓶霉属菌株.菌株GZUIFR 21.872和GZUIFR 21.873与角膜拟单胞瓶霉(Phialemoniopsis oc-ularis)的形态特征非常相近,且系统发育上与该种的模式菌株以较高的支持率聚在一个亚分支;菌株GZUIFR 21.874和GZUIFR 21.875与内生拟单胞瓶霉(Phialemoniopsis endophytica)的形态特征非常相近,且系统发育上与该种的模式菌株以较高的支持率聚在一个亚分支;此外,菌株GZUIFR 21.876和GZUIFR 21.877与多腔拟单胞瓶霉(Phialemoniopsis pluriloculosa)的形态特征非常相近,且系统发育上与该种的模式菌株以较高的支持率聚在一个亚分支.调查结果表明,角膜拟单胞瓶霉和多腔拟单胞瓶霉为中国新记录种;内生拟单胞瓶霉首次分离自土壤,营腐生生活,这三个拟单胞瓶霉属成员的发现进一步丰富了我国拟单胞瓶霉属的物种资源.

关键词：

分类学系统发育腐生真菌拟单胞瓶霉属角蛋白

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不同种植年限薰衣草根际细菌多样性分析

邓霞师仁增王自健王君竹...

22-31页

查看更多>>摘要：根际微生物群落结构和多样性对薰衣草生长起着重要作用.为探究不同种植年限薰衣草根际土壤细菌群落结构和多样性特征及其影响,采集新疆伊犁伊宁县种植年限1、3、5 a,以及未种植薰衣草的土壤,对V4序列进行Illumina高通量测序.结果表明,Alpha多样性分析显示,随着种植年限的延长,Shannon指数和Chao指数逐渐降低,物种丰富度和细菌群落多样性降低.在种植薰衣草土壤中共检测到51个门,146个纲,357个目,533个科,1024个属.在门水平上,相对丰度≥5％的有变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Acti-nobacteria)等6个优势菌门;在属水平上优势菌属为凯斯特菌(Kaistobacter)、节细菌属(Arthrobacter)等6个优势菌属,随着种植年限的延长,凯斯特菌和鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)数量逐渐增加,芽胞杆菌属(Bacil-lus)先增加后下降,节细菌属表现为先下降后增加的趋势.LEfSe分析检测表明,与种植处理组相比,对照组主要特征细菌属为盐坑微菌属(Salinimicrobium).种植1 a的主要特征细菌属为糖霉菌属(Glycomyces)、杆状孢囊菌属(Virgisporangium)等4个细菌属.种植3 a的主要特征细菌属为慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和生丝微菌属(Hyphomicrobium).种植5 a的主要特征细菌属为博斯氏菌属(Bosea)、硝酸菌属(Azohydromonas)等4个细菌属.随着种植年限的延长,薰衣草根际土壤细菌群落结构和多样性有降低的趋势.

关键词：

高通量测序根际微生物微生物多样性薰衣草连续种植

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杜仲不同组织内生真菌种类组成及功能特征

冉青松董醇波邵秋雨张学倩...

32-41页

查看更多>>摘要：探究杜仲不同组织可培养内生真菌组成及其与次生代谢产物之间的潜在关系.基于传统的可培养分离法分离内生真菌,根据形态学和分子系统学对其进行鉴定;并进一步采用平板对峙法探究内生真菌对松脂醇二葡萄糖苷的响应.从杜仲根、皮、叶中分离内生真菌共285株,隶属于46个属66个种,三个部位共有种仅有1个,即黑曲霉(Aspergillus niger).树皮、树根、树叶特有种分别有32个、14个和9个.经FUNGuild软件平台解析显示,可培养内生真菌在功能上大部分集中在植物病原菌、腐生菌、内生菌,少部分为动物病原菌和地衣寄生菌.进一步对峙实验表明,松脂醇二葡萄糖苷对12种菌株分别产生了不同程度的促进和抑制,其中对变黑吉布氏菌(Gibellulopsis nigrescens)促进率最大,为10％,而对粉红螺旋聚孢霉(Clonostachys rosea)的促进率最低,为3％;对了灰葡萄孢(Botrytis cinerea)抑制效果最强,抑制率高达35％;对皮落青霉(Penicillium crus-tosum)抑制效果最差,抑制率仅为3％.结果表明,杜仲具有丰富的内生真菌,不同部位内生真菌组成差异明显,树皮中的物种数高于根和叶部位,杜仲活性成分松脂醇二葡萄糖苷对内生真菌具有不同程度的促进和抑制作用.

关键词：

杜仲内生真菌真菌多样性功能特征松脂醇二葡萄糖苷

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Bacillus megaterium ZS-3最佳发酵培养条件优化

祝小霞石慧敏叶建仁

42-52页

查看更多>>摘要：为提升巨大芽胞杆菌(Bacillus megaterium)ZS-3有效菌体数量,降低ZS-3发酵成本,通过单因素、正交与响应面相结合的方法探究ZS-3产活菌数最高的碳源、氮源、无机盐、转速、装液量、pH、温度和接菌量等培养条件.单因素与正交实验筛选得ZS-3最适培养基与比例为碳源1.0％(质量分数)、氮源0.5％、磷酸氢二铵0.5％和十二水合硫酸铝钾0.5％;响应面优化后ZS-3培养条件为装液量40％、转速200 r/min、pH值6.67、培养温度30.37℃、接种量1.31％(体积分数)时生物量达到最高,优化后培养的菌体数量可达到1.21×109 cfu/mL.经过优化后ZS-3活菌数为原始培养条件产生的活菌数的3.9倍.降低了发酵成本,为未来可能的工业化扩大发酵生产提供参考与数据支持.

关键词：

巨大芽胞杆菌正交实验活菌数响应面法PB实验BBD实验培养条件优化

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红托竹荪菌托多酚提取工艺响应面法优化及其抗氧化活性分析

柴林山李剑梅张疏雨陈飞...

53-61页

查看更多>>摘要：为评价红托竹荪菌托中多酚类化合物水平,实现菌托副产物资源化利用.首先对4个提取条件(乙醇体积分数、超声时间、提取温度和料液)进行单因素试验,再利用响应面法对筛选的4个因素进行提取条件优化,并分析菌托多酚的抗氧化活性.获得红托竹荪菌托多酚提取量最佳工艺条件:乙醇体积分数50％,超声时间16 min,提取温度54℃,料液比1︰15(g/mL).最佳条件下,多酚的实际提取量为9.15 mg/g.菌托多酚呈现出较好的抗氧化活性,在菌托多酚质量浓度为0.80 mg/mL时,总抗氧化能力达到0.643Troloxμmol/mL,DPPH自由基、羟自由基和超氧阴离子自由基的清除率分别为71.45％、79.02％和60.38％.结果表明,红托竹荪菌托富含多酚物质,且多酚具较好抗氧化活性,对菌托多酚提取工艺优化可为菌托资源化利用的提供参考.

关键词：

红托竹荪(Dictyophorarubrovalvata)菌托多酚提取工艺抗氧化活性

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碳源对球孢白僵菌分生孢子质量的影响

陈金峰龙静樊可张静姝...

62-68页

查看更多>>摘要：分生孢子对球孢白僵菌(Beauveria bassiana)的繁殖和毒力至关重要.为提高分生孢子质量,将球孢白僵菌接种于不同碳源PDA培养基上,分析不同碳源对分生孢子细胞壁结构成分、细胞内抗氧化酶活性、海藻糖含量和相关基因表达的影响,并进一步探究碳源和调控分生孢子发育基因的关系.结果显示,以葡萄糖为对照,果糖、麦芽糖、蔗糖为碳源培养的分生孢子细胞壁多糖、细胞内抗氧化酶和海藻糖合成酶以及分生孢子发育等相关基因的表达量被显著上调;多糖含量和抗氧化酶活性为果糖>麦芽糖>蔗糖>葡萄糖>乳糖,海藻糖含量为蔗糖>果糖>麦芽糖>葡萄糖>乳糖.通过探究碳源对分生孢子质量的影响,为真菌的抗逆筛选提供参考.

关键词：

球孢白僵菌碳源分生孢子细胞壁质量

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云南江城县荒川库蠓中肠可培养细菌的分离及鉴定

孟锦昕李楠何于雯杨振兴...

69-77页

查看更多>>摘要：荒川库蠓(Culicoides arakawae)是鸡场中一种常见的吸血昆虫,主要传播鸡住白细胞虫病和禽痘等多种禽类疾病,为了解荒川库蠓中肠可培养细菌的种类及群落组成,为将来研究荒川库蠓肠道细菌对疾病传播的影响提供前期工作基础,以江城县荒川库蠓为材料,分离鉴定荒川库蠓中肠可培养细菌.使用灯诱法采集库蠓标本,挑选出不饱血的雌性荒川库蠓,解剖其中肠并研磨,分离中肠可培养细菌,结合16S rDNA进行序列测定并分析.结果表明,获得4只荒川库蠓中肠中可培养菌落8419个,纯化获得菌株38株,隶属于2门5科6属10种,优势菌群为革兰阳性菌,占分离菌株总数的57.89％,优势菌株为葡萄球菌属(Staphylococcus)菌株,占总分离菌株的55.26％.江城县荒川库蠓中肠可培养细菌属于变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmi-cutes),以葡萄球菌属为主.

关键词：

荒川库蠓中肠可培养细菌优势菌群葡萄球菌

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淡紫灰链霉菌BP39基因组密码子使用偏好性分析

柯清林上官宏斌罗睿晗崔立操...

78-84页

查看更多>>摘要：淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)BP39是一株具有广谱杀菌性能的生防菌.为探讨菌株BP39基因组密码子的偏好性,本研究基于菌株BP39的6356条编码序列,利用CodonW软件,计算其GC含量、有效密码子数(ENC)和同义密码子相对使用频率(RSCU)等偏好性参数.结果表明,菌株BP39基因组密码子具有较强的偏好性,PR2-plot分析、ENC-plot曲线与中性绘图分析显示,基因组密码子使用模式受到选择压力和突变压力等多重因素影响,以自然选择压力为主导;从64个密码子中鉴定出20个最优密码子,均以C或G结尾,其中以C结尾占75％;相关性分析揭示,基因组碱基组成影响密码子偏好性,且同义密码子第3位碱基组成直接影响最优密码子使用偏性,最优密码子的基因高表达与密码子第3位C关系密切.研究结果为菌株BP39基因工程改造及外源基因表达提供参考.

关键词：

淡紫灰链霉菌基因组密码子偏好性最优密码子碱基组成

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洞庭湖水系4个淡水养殖湖表层沉积物微生物群落结构及其环境驱动因子

唐白露文晓萱胡蓉魏荣...

85-93页

查看更多>>摘要：为探究淡水养殖湖表层沉积物微生物群落结构及其环境影响因子,以环洞庭湖水系4个淡水养殖湖表层沉积物为研究对象,采用高通量测序技术对沉积物中微生物多样性、群落结构及其与环境因子间的响应关系进行分析.结果表明4个淡水养殖湖表层沉积物氮、磷和有机污染问题严重.物种丰富度排序为津市西湖>澧县北民湖>汉寿县安乐湖>华容县东湖,物种多样性排序为汉寿县安乐湖>澧县北民湖>津市西湖>华容县东湖.沉积物中变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度最大,细菌以在属水平上没有明确的分类信息或分类名称的菌属及未能在体外分离培养的菌属为主.Spearman相关性分析表明pH、硝态氮、铵态氮、有机磷和无机磷是影响沉积物细菌群落结构的主要因素.冗余分析表明,铵态氮是影响沉积物细菌群落结构的关键环境驱动因子.研究结果可为淡水养殖湖的治理和维护提供参考,推动环洞庭湖水系水产养殖业的健康、可持续发展.

关键词：

淡水养殖湖表层沉积物环境因子细菌群落结构微生物多样性高通量测序技术

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