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张拥军

季刊

1674-2850

e-paper@paper.edu.cn

010-62514595 62514685

100080

北京市海淀区中关村大街35号

中国科技论文在线精品论文/Journal Highlights of Sciencepaper Online
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    五肽重复蛋白的结构和功能研究进展

    李锟朱荣利龙凤
    1-9页
    查看更多>>摘要:五肽重复蛋白(pentapeptide repeat proteins,PRPs)是一类超家族蛋白,在近3 500个物种中有超过38 000个序列,大多数属于蓝藻,但在生命的所有分支中都有分布,PRPs在不同物种中功能各异,在生物体内涉及到多个生物学过程.本文主要对PRPs的五肽重复序列、三维结构以及相关功能的特点进行总结,旨在阐述PRPs的蛋白结构特征以及在不同物种中相关的生理功能,为后续PRPs的深入研究提供重要的理论依据.

    微生物学五肽重复蛋白综述晶体结构生物学功能

    鄱阳湖南矶湿地蜘蛛及其昆虫猎物多样性季节变化与群落功能分析

    陈连水袁凤辉饶军张针针...
    10-24页
    查看更多>>摘要:研究旨在探讨蜘蛛及其昆虫猎物对湿地生态系统结构的稳定性及能量与物质循环的指示作用,为鄱阳湖南矶湿地国家级自然保护区生物多样性的保护与利用提供参考.结合景观生态原理,采用群落样点设置与观察、关联标本采集与鉴定等生态定量调查及多样性分析方法.本次调查共采得蜘蛛 16 科 50 属 73 种,得到的结论如下:1)群落结构与功能分析表明,南矶灌丛为蜘蛛繁育发生提供了庇护所,充当蛛库;南矶草甸是蜘蛛捕食行为实战与演化的平台,南矶林地是各类蜘蛛限时汇聚、适时飞航的踏板;在春夏季,南矶草甸中的水生或地栖昆虫是蜘蛛的主要偏好猎物或潜在捕食对象,进入秋冬季,南矶灌丛或林地成为不常见昆虫的汇集地;它们分别主导着南矶蜘蛛及其昆虫猎物群落丰富度、优势度、多样性和均匀度的高低起伏.2)聚类分析表明,南矶湿地各蜘蛛群落间的交流频率与连续性程度受地域异质性和空间距离的限制较为明显,群落类型的内聚作用和发散功能稳定;各昆虫猎物群落间的交流频率与连续性程度受时域同质化和季节物候的影响较为明显,群落类型的边缘差异与斑块功能稳定.3)相关分析表明,蜘蛛及其昆虫猎物群落在春夏季、秋冬季和总体上的各项多样性指数互有关联,且部分时空指数存在交错相关现象,地域与季节性温湿度等物候条件的变化是其主要驱动力.蜘蛛和昆虫是食物链中两个重要的中间环节,它们共同维持着南矶湿地生态系统的运转和平衡.

    动物学南矶湿地蜘蛛昆虫猎物多样性季节变化群落功能

    aGVHD对小鼠肠道血管形态与结构的影响及其机制

    郭书欣黄玉辉
    25-40页
    查看更多>>摘要:为了探究急性移植物抗宿主病(acute graft-versus-host disease,aGVHD)发病进程对小鼠肠道组织血管的变化和肠道免疫稳态之间的关系和机制,我们建立小鼠aGVHD模型分析小鼠小肠绒毛血管内皮细胞和周细胞以及浸润免疫细胞在不同时间点的动态变化,并运用qPCR、Smart-seq技术分析寻找差异表达基因.发现在aGVHD的发病进程中,小肠绒毛血管的损伤及浸润免疫细胞的变化与疾病进程密切相关,随炎症反应、细胞凋亡及肠道屏障相关基因表达显著变化.研究结果表明,aGVHD诱发的小肠绒毛血管的严重损伤和结构紊乱可能是导致受体死亡的一个重要原因,小肠绒毛的aGVHD炎症反应可能主要通过影响与内皮细胞凋亡及肠道屏障相关的基因表达,从而破坏小肠绒毛血管的完整性和提高其通透性.

    生物学其他学科急性移植物抗宿主病炎症反应肠道血管内皮细胞周细胞

    小麦miR166基因家族鉴定及表达分析

    雷晓彤徐渴孙若希张树华...
    41-49页
    查看更多>>摘要:miR166 作为重要的转录后调节因子,在植物的生长发育和对逆境胁迫的反应中扮演着重要的角色.利用PmiREN、Ensembl Plants数据库、MEGA-X、DNAMAN软件以及RNAfold web server、WebLogo和psRNA Target 在线网站对小麦 miR166(Tae-miR166)基因家族的进化特性和表达模式进行分析.在 PmiREN 数据库中搜索到 19 个Tae-miR166 基因家族成员,染色体定位发现Tae-miR166 成员定位于 14 条染色体上.序列比对发现Tae-miR166 的成熟体序列高度保守.进化分析结果表明,Tae-miR166 基因家族成员分别处于 4 个进化分支.靶基因预测结果表明,Tae-miR166 的靶基因包括Ⅲ类同源异型结构域亮氨酸拉链蛋白、β半乳糖苷酶和钙依赖性蛋白激酶等.转录组数据分析表明Tae-miR166 家族 19 个成员在小麦 6 个组织中都有表达,在籽粒和穗中表达量最高.荧光定量 PCR 结果表明,Tae-miR166 家族 15 个成员在镉、干旱和低温胁迫处理后的表达模式存在差异,说明 Tae-miR166 基因家族在植株抵御非生物胁迫时发挥着重要作用.本研究为进一步阐明Tae-miR166 基因家族的功能提供了理论依据.

    农艺学Tae-miR166小麦进化特征靶基因

    小麦miR164基因家族的生物信息学分析及靶基因预测

    武宁静徐渴曹慧雯张树华...
    50-58页
    查看更多>>摘要:miR164 家族是植物中一类特有的保守小RNA分子,广泛参与植物的生长发育及各种逆境胁迫响应.为了解小麦Tae-miR164 基因家族成员的进化特征、表达模式及功能,对PmiREN数据库中Tae-miR164 基因进行了生物信息学分析.结果共鉴定到 13 个家族成员,成簇于小麦Chr1、Chr2 和Chr6 等 3 条染色体上.序列比对发现Tae-miR164 家族 13 个成员的成熟序列均为 21 bp,且相似性较高,仅在 5'端第 21 个核苷酸处存在差异,前体序列均能形成稳定的二级茎环结构,成熟的miRNA序列处于 5'端臂上.进化树分析表明,拟南芥、水稻、玉米、二穗短柄草、大麦、谷子、苜蓿、番茄和小麦中Tae-miR164 家族成员主要分为 4 个分支.靶基因预测表明,Tae-miR164 基因家族成员对应的靶基因为 NAC 转录因子家族成员.转录组数据分析表明,Tae-miR164a/b/c/d/e/f/g/h/i/m 在小麦 6 个组织中均有表达,Tae-miR164j/k/l 在花和籽粒中几乎不表达.实时荧光定量PCR结果表明,低温(4℃)胁迫处理 48 h的小麦茎基部中Tae-miR164 家族成员呈明显上调的表达模式.本研究为小麦Tae-miR164 家族成员的功能鉴定奠定了理论基础.

    农艺学小麦Tae-miR164基因家族系统进化靶基因预测

    肿瘤微环境在细胞休眠中的作用及机制

    肖羽淇潘燕邵春林
    59-70页
    查看更多>>摘要:转移和复发是晚期肿瘤患者死亡的主要原因,是当前肿瘤治疗的瓶颈.近年来研究发现肿瘤休眠在转移和复发中发挥了重要作用.肿瘤休眠后可在机体内潜伏多年,对放化疗表现出耐受性,是肿瘤复发的重要因素,也是具有临床治疗价值的潜在靶点.现阶段肿瘤休眠可分为细胞休眠、血管性休眠与免疫性休眠.其中细胞休眠指细胞处于可逆的细胞周期阻滞状态,细胞分裂减慢或停止.细胞休眠多伴有细胞增殖因子 Ki-67的减少与细胞周期蛋白调节的缺失,可使细胞获得治疗抗性与免疫抗性.本文重点关注肿瘤细胞休眠,探讨肿瘤微环境与休眠细胞间的相互影响,以期为肿瘤临床试验提供新思路.

    放射医学肿瘤学综述肿瘤细胞休眠肿瘤微环境

    高效液相色谱法测定异烟酸辛酰肼含量

    吴林静马成郭梦琴黄郑炜...
    71-78页
    查看更多>>摘要:目的:异烟肼及其衍生物作为治疗肺结核的一线药物,其含量测定在药物的研发及应用中至关重要.然而,异烟肼的含量测定方法虽常有报道,但是针对异烟肼衍生物的含量测定方法却鲜有报道.因此本研究构建一种适用于测定异烟酸辛酰肼(INH-CHO)的反相高效液相色谱法(reverse-phase high performance liquid chromatography,RP-HPLC),用于INH-CHO的含量检测.方法:采用Capcell Pak C18 MG Ⅱ S5 色谱柱,柱温为30℃,以pH=6.0磷酸盐缓冲液:甲醇=30:70为流动相进行洗脱,流速为1 mL/min,进样0.02 mL,在262 nm处检测,考察该方法学的线性关系、精密度、准确度及定量限.结果:INH-CHO的保留时间为 9.2 min,在 1~240 μg/mL、0.1~1 μg/mL浓度范围内都具有较好的线性关系(R²>0.999 0),在该色谱条件下测定INH-CHO的日内精密度、日间精密度、准确度较好,定量限为 0.1 μg/mL.结论:在实验浓度范围内,该方法线性良好、操作简便、结果精确、可重现,适用于INH-CHO的含量检测.

    药剂学反相高效液相色谱法INH-CHO含量测定

    EML3与H3K4M融合蛋白表达质粒的构建及蛋白的表达与纯化

    王卓文刘艳丽
    79-90页
    查看更多>>摘要:目的:研究获得N端/C端融合组蛋白H3K4M小肽的EML3 融合蛋白的方法.方法:将组蛋白H3(aa 1~15)小肽编码区融合进表达EML3 Agenet结构域重组质粒中,得到N端/C端融合表达H3K4M的质粒,转化至大肠杆菌BL21(DE3)中.经扩大培养,加入IPTG后在 15℃条件下诱导 6×His标签EML3 融合蛋白的表达.经镍柱亲和层析及凝胶过滤层析进行纯化后,通过 SDS-PAGE 和考马斯亮蓝染色检测蛋白的纯度.结果:通过质粒单点突变、质粒酶切、PCR克隆以及同源重组连接,成功构建EML3 N/C端融合组蛋白H3K4M的重组质粒,测序证实序列正确,而且重组质粒可在大肠杆菌中成功诱导融合蛋白的表达.其中 EML3 C 端融合组蛋白H3K4M可通过凝血酶酶切从而得到游离的H3K4M小肽以及EML3 Agenet结构域蛋白.结论:成功构建EML3 融合组蛋白H3K4M重组质粒,并诱导表达及纯化得到高纯度的EML3 融合蛋白.

    微生物药物学组蛋白H3K4M小肽EML3Agenet结构域融合蛋白质粒构建蛋白表达纯化

    新冠Omicron变异株的人群感染数学模型研究

    桑晓倩林孟晨鲍贵栋吴云峰...
    91-98页
    查看更多>>摘要:本文建立了可预测 Omicron 变异株对社会人群感染的数学模型,通过模型参数描述了 Omicron 变异株的免疫逃逸特性,并采用下一代矩阵方法计算了模型的基本再生数,随后根据常微分方程的驻点稳定性理论分析,得出该模型的流行病稳态驻点解是全局渐进稳定的结论.本文依据国家卫健委发布的疫情数据和厦门市的人口普查数据,对模型各参数进行赋值,仿真模拟了厦门市在 2022 年 12 月至 2023 年 7 月期间的社会人群新冠病毒感染趋势,为政府相关部门优化疫情防控策略提供数学模型技术支持.

    传染病学基本再生数新型冠状病毒稳定性理论

    考虑多车配合的AutoStore系统订单拣选排序研究

    马云峰崔宇昊邹雅倩胡依娜...
    99-110页
    查看更多>>摘要:为解决AutoStore系统中由于严格要求单辆小车参与整套拣货动作而导致的相同料箱多次翻拣及大量重复成本问题,本文提出堆垛检索概念并设计多车协同拣货作业流程,以减少对料箱的重复翻箱.基于该作业方式建立订单排序优化模型用于求解最优订单序列,并进一步设计了启发式算法SA用于大规模算例求解.数值实验显示,在小规模问题中,SA 算法与数学模型最优解的误差仅为 0.95%~3.5%;在大规模问题中,SA的性能高出现有方法 15%~72%.结果证明了该种作业流程的有效性及SA算法求解订单排序问题的优越性.

    运输系统工程订单排序启发式算法AutoStore系统多车协同